Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCGB2A2Q13296 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCGB2A2Q13296 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SCGB2A2Q13296 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCGB2A2Q13296 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCGB2A2Q13296 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCGB2A2Q13296 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCGB2A2Q13296 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCGB2A2Q13296 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCGB2A2Q13296 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCGB2A2Q13296 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCGB2A2Q13296 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCGB2A2Q13296 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCGB2A2Q13296 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCGB2A2Q13296 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCGB2A2Q13296 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCGB2A2Q13296 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCGB2A2Q13296 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCGB2A2Q13296 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCGB2A2Q13296 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCGB2A2Q13296 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCGB2A2Q13296 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCGB2A2Q13296 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCGB2A2Q13296 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCGB2A2Q13296 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCGB2A2Q13296 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCGB2A2Q13296 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCGB2A2Q13296 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCGB2A2Q13296 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCGB2A2Q13296 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCGB2A2Q13296 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCGB2A2Q13296 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SCGB2A2Q13296 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCGB2A2Q13296 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCGB2A2Q13296 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCGB2A2Q13296 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCGB2A2Q13296 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCGB2A2Q13296 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SCGB2A2Q13296 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
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SCGB2A2Q13296 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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SCGB2A2Q13296 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCGB2A2Q13296 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCGB2A2Q13296 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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SCGB2A2Q13296 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCGB2A2Q13296 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCGB2A2Q13296 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCGB2A2Q13296 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCGB2A2Q13296 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCGB2A2Q13296 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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SCGB2A2Q13296 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SCGB2A2Q13296 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SCGB2A2Q13296 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
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SCGB2A2Q13296 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCGB2A2Q13296 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCGB2A2Q13296 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCGB2A2Q13296 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCGB2A2Q13296 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCGB2A2Q13296 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCGB2A2Q13296 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SCGB2A2Q13296 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SCGB2A2Q13296 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCGB2A2Q13296 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SCGB2A2Q13296 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCGB2A2Q13296 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCGB2A2Q13296 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCGB2A2Q13296 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCGB2A2Q13296 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SCGB2A2Q13296 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCGB2A2Q13296 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SCGB2A2Q13296 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCGB2A2Q13296 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCGB2A2Q13296 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCGB2A2Q13296 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCGB2A2Q13296 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCGB2A2Q13296 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCGB2A2Q13296 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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