Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRSF6Q13247 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRSF6Q13247 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRSF6Q13247 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRSF6Q13247 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRSF6Q13247 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRSF6Q13247 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRSF6Q13247 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRSF6Q13247 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRSF6Q13247 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SRSF6Q13247 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRSF6Q13247 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRSF6Q13247 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRSF6Q13247 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRSF6Q13247 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRSF6Q13247 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRSF6Q13247 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRSF6Q13247 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SRSF6Q13247 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SRSF6Q13247 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRSF6Q13247 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRSF6Q13247 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRSF6Q13247 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRSF6Q13247 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SRSF6Q13247 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRSF6Q13247 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SRSF6Q13247 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRSF6Q13247 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRSF6Q13247 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRSF6Q13247 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRSF6Q13247 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRSF6Q13247 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRSF6Q13247 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRSF6Q13247 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRSF6Q13247 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRSF6Q13247 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRSF6Q13247 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRSF6Q13247 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRSF6Q13247 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRSF6Q13247 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRSF6Q13247 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRSF6Q13247 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SRSF6Q13247 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRSF6Q13247 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRSF6Q13247 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRSF6Q13247 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRSF6Q13247 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SRSF6Q13247 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRSF6Q13247 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRSF6Q13247 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SRSF6Q13247 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRSF6Q13247 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRSF6Q13247 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRSF6Q13247 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRSF6Q13247 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRSF6Q13247 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRSF6Q13247 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRSF6Q13247 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRSF6Q13247 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRSF6Q13247 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRSF6Q13247 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRSF6Q13247 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRSF6Q13247 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRSF6Q13247 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRSF6Q13247 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SRSF6Q13247 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRSF6Q13247 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRSF6Q13247 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRSF6Q13247 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRSF6Q13247 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRSF6Q13247 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRSF6Q13247 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRSF6Q13247 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRSF6Q13247 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRSF6Q13247 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRSF6Q13247 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRSF6Q13247 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRSF6Q13247 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRSF6Q13247 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRSF6Q13247 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRSF6Q13247 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRSF6Q13247 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRSF6Q13247 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRSF6Q13247 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRSF6Q13247 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRSF6Q13247 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRSF6Q13247 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRSF6Q13247 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRSF6Q13247 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SRSF6Q13247 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SRSF6Q13247 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRSF6Q13247 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRSF6Q13247 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRSF6Q13247 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SRSF6Q13247 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRSF6Q13247 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRSF6Q13247 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRSF6Q13247 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRSF6Q13247 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRSF6Q13247 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
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