Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ECH1Q13011 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ECH1Q13011 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ECH1Q13011 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ECH1Q13011 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ECH1Q13011 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ECH1Q13011 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ECH1Q13011 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ECH1Q13011 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ECH1Q13011 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ECH1Q13011 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ECH1Q13011 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ECH1Q13011 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ECH1Q13011 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ECH1Q13011 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ECH1Q13011 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ECH1Q13011 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ECH1Q13011 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ECH1Q13011 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ECH1Q13011 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ECH1Q13011 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ECH1Q13011 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ECH1Q13011 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ECH1Q13011 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ECH1Q13011 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ECH1Q13011 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ECH1Q13011 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ECH1Q13011 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ECH1Q13011 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ECH1Q13011 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ECH1Q13011 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ECH1Q13011 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ECH1Q13011 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ECH1Q13011 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ECH1Q13011 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ECH1Q13011 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ECH1Q13011 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ECH1Q13011 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ECH1Q13011 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ECH1Q13011 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ECH1Q13011 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ECH1Q13011 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECH1Q13011 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECH1Q13011 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECH1Q13011 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECH1Q13011 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECH1Q13011 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECH1Q13011 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECH1Q13011 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ECH1Q13011 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ECH1Q13011 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ECH1Q13011 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ECH1Q13011 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECH1Q13011 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECH1Q13011 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECH1Q13011 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECH1Q13011 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECH1Q13011 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECH1Q13011 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECH1Q13011 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECH1Q13011 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECH1Q13011 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECH1Q13011 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECH1Q13011 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECH1Q13011 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ECH1Q13011 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECH1Q13011 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECH1Q13011 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECH1Q13011 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECH1Q13011 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECH1Q13011 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECH1Q13011 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECH1Q13011 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECH1Q13011 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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