Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN13Q12923 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN13Q12923 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN13Q12923 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN13Q12923 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN13Q12923 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN13Q12923 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN13Q12923 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN13Q12923 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN13Q12923 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN13Q12923 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN13Q12923 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN13Q12923 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN13Q12923 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN13Q12923 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN13Q12923 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN13Q12923 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN13Q12923 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN13Q12923 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN13Q12923 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN13Q12923 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN13Q12923 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPN13Q12923 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN13Q12923 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN13Q12923 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN13Q12923 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN13Q12923 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN13Q12923 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN13Q12923 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN13Q12923 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN13Q12923 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN13Q12923 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN13Q12923 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN13Q12923 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN13Q12923 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN13Q12923 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN13Q12923 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN13Q12923 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN13Q12923 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN13Q12923 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN13Q12923 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN13Q12923 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN13Q12923 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN13Q12923 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN13Q12923 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN13Q12923 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN13Q12923 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPN13Q12923 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN13Q12923 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN13Q12923 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN13Q12923 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN13Q12923 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN13Q12923 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN13Q12923 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN13Q12923 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN13Q12923 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN13Q12923 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN13Q12923 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN13Q12923 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPN13Q12923 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN13Q12923 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN13Q12923 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN13Q12923 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN13Q12923 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPN13Q12923 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN13Q12923 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN13Q12923 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN13Q12923 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN13Q12923 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN13Q12923 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN13Q12923 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN13Q12923 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN13Q12923 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN13Q12923 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN13Q12923 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN13Q12923 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN13Q12923 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN13Q12923 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN13Q12923 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN13Q12923 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN13Q12923 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN13Q12923 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN13Q12923 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN13Q12923 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN13Q12923 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN13Q12923 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN13Q12923 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN13Q12923 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN13Q12923 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN13Q12923 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN13Q12923 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPN13Q12923 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN13Q12923 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN13Q12923 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN13Q12923 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN13Q12923 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPN13Q12923 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN13Q12923 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN13Q12923 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN13Q12923 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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