Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
TROQ12816 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
TROQ12816 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
TROQ12816 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
TROQ12816 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
TROQ12816 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
TROQ12816 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
TROQ12816 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
TROQ12816 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
TROQ12816 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
TROQ12816 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
TROQ12816 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
TROQ12816 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
TROQ12816 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
TROQ12816 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
TROQ12816 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
TROQ12816 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
TROQ12816 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
TROQ12816 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
TROQ12816 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
TROQ12816 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
TROQ12816 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
TROQ12816 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
TROQ12816 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
TROQ12816 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
TROQ12816 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
TROQ12816 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC38.04■■■■□ 3.68
TROQ12816 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
TROQ12816 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
TROQ12816 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
TROQ12816 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
TROQ12816 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
TROQ12816 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
TROQ12816 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
TROQ12816 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
TROQ12816 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
TROQ12816 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
TROQ12816 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
TROQ12816 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
TROQ12816 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
TROQ12816 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
TROQ12816 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
TROQ12816 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
TROQ12816 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
TROQ12816 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
TROQ12816 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
TROQ12816 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
TROQ12816 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
TROQ12816 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
TROQ12816 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
TROQ12816 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
TROQ12816 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
TROQ12816 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
TROQ12816 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
TROQ12816 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
TROQ12816 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
TROQ12816 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
TROQ12816 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
TROQ12816 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
TROQ12816 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
TROQ12816 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
TROQ12816 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
TROQ12816 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
TROQ12816 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
TROQ12816 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
TROQ12816 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
TROQ12816 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
TROQ12816 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
TROQ12816 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
TROQ12816 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
TROQ12816 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
TROQ12816 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
TROQ12816 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
TROQ12816 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
TROQ12816 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
TROQ12816 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
TROQ12816 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.66
TROQ12816 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC37.88■■■■□ 3.66
TROQ12816 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
TROQ12816 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
TROQ12816 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
TROQ12816 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
TROQ12816 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
TROQ12816 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
TROQ12816 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
TROQ12816 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
TROQ12816 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
TROQ12816 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
TROQ12816 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
TROQ12816 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
TROQ12816 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
TROQ12816 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
TROQ12816 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
TROQ12816 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
TROQ12816 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
TROQ12816 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
TROQ12816 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
TROQ12816 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
TROQ12816 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
TROQ12816 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms