Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCAPQ12770 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCAPQ12770 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCAPQ12770 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAPQ12770 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAPQ12770 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAPQ12770 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAPQ12770 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAPQ12770 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAPQ12770 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAPQ12770 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAPQ12770 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAPQ12770 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAPQ12770 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAPQ12770 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAPQ12770 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAPQ12770 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAPQ12770 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAPQ12770 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAPQ12770 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAPQ12770 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAPQ12770 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAPQ12770 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAPQ12770 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAPQ12770 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAPQ12770 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAPQ12770 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAPQ12770 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAPQ12770 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAPQ12770 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAPQ12770 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAPQ12770 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAPQ12770 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAPQ12770 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAPQ12770 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAPQ12770 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAPQ12770 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAPQ12770 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAPQ12770 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAPQ12770 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAPQ12770 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAPQ12770 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAPQ12770 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAPQ12770 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAPQ12770 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAPQ12770 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAPQ12770 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAPQ12770 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAPQ12770 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAPQ12770 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAPQ12770 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAPQ12770 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAPQ12770 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAPQ12770 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAPQ12770 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAPQ12770 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAPQ12770 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAPQ12770 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAPQ12770 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAPQ12770 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAPQ12770 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAPQ12770 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAPQ12770 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
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