Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CPSF1Q10570 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CPSF1Q10570 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CPSF1Q10570 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CPSF1Q10570 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CPSF1Q10570 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CPSF1Q10570 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
CPSF1Q10570 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
CPSF1Q10570 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CPSF1Q10570 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CPSF1Q10570 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CPSF1Q10570 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CPSF1Q10570 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CPSF1Q10570 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
CPSF1Q10570 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CPSF1Q10570 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CPSF1Q10570 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
CPSF1Q10570 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CPSF1Q10570 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CPSF1Q10570 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CPSF1Q10570 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CPSF1Q10570 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CPSF1Q10570 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CPSF1Q10570 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CPSF1Q10570 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CPSF1Q10570 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CPSF1Q10570 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CPSF1Q10570 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CPSF1Q10570 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CPSF1Q10570 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CPSF1Q10570 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CPSF1Q10570 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CPSF1Q10570 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CPSF1Q10570 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CPSF1Q10570 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CPSF1Q10570 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CPSF1Q10570 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CPSF1Q10570 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CPSF1Q10570 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CPSF1Q10570 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CPSF1Q10570 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
CPSF1Q10570 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
CPSF1Q10570 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CPSF1Q10570 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CPSF1Q10570 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CPSF1Q10570 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CPSF1Q10570 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CPSF1Q10570 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CPSF1Q10570 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CPSF1Q10570 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CPSF1Q10570 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
CPSF1Q10570 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CPSF1Q10570 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CPSF1Q10570 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CPSF1Q10570 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CPSF1Q10570 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CPSF1Q10570 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CPSF1Q10570 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CPSF1Q10570 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CPSF1Q10570 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CPSF1Q10570 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CPSF1Q10570 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CPSF1Q10570 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CPSF1Q10570 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CPSF1Q10570 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CPSF1Q10570 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CPSF1Q10570 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CPSF1Q10570 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
CPSF1Q10570 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
CPSF1Q10570 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
CPSF1Q10570 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
CPSF1Q10570 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CPSF1Q10570 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CPSF1Q10570 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CPSF1Q10570 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CPSF1Q10570 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CPSF1Q10570 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CPSF1Q10570 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CPSF1Q10570 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CPSF1Q10570 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CPSF1Q10570 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
CPSF1Q10570 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CPSF1Q10570 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CPSF1Q10570 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CPSF1Q10570 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CPSF1Q10570 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CPSF1Q10570 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CPSF1Q10570 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CPSF1Q10570 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
CPSF1Q10570 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CPSF1Q10570 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CPSF1Q10570 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CPSF1Q10570 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CPSF1Q10570 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CPSF1Q10570 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CPSF1Q10570 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CPSF1Q10570 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CPSF1Q10570 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CPSF1Q10570 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CPSF1Q10570 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
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