Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C2orf54Q08AI8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C2orf54Q08AI8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C2orf54Q08AI8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C2orf54Q08AI8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C2orf54Q08AI8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C2orf54Q08AI8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C2orf54Q08AI8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C2orf54Q08AI8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C2orf54Q08AI8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C2orf54Q08AI8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C2orf54Q08AI8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C2orf54Q08AI8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C2orf54Q08AI8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C2orf54Q08AI8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C2orf54Q08AI8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C2orf54Q08AI8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
C2orf54Q08AI8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
C2orf54Q08AI8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C2orf54Q08AI8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C2orf54Q08AI8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C2orf54Q08AI8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
C2orf54Q08AI8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
C2orf54Q08AI8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C2orf54Q08AI8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C2orf54Q08AI8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C2orf54Q08AI8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C2orf54Q08AI8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C2orf54Q08AI8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C2orf54Q08AI8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C2orf54Q08AI8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C2orf54Q08AI8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C2orf54Q08AI8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C2orf54Q08AI8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C2orf54Q08AI8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C2orf54Q08AI8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C2orf54Q08AI8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C2orf54Q08AI8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C2orf54Q08AI8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C2orf54Q08AI8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C2orf54Q08AI8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C2orf54Q08AI8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C2orf54Q08AI8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C2orf54Q08AI8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C2orf54Q08AI8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C2orf54Q08AI8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C2orf54Q08AI8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C2orf54Q08AI8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C2orf54Q08AI8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C2orf54Q08AI8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C2orf54Q08AI8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C2orf54Q08AI8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C2orf54Q08AI8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C2orf54Q08AI8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C2orf54Q08AI8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C2orf54Q08AI8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms