Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACSM1Q08AH1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSM1Q08AH1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSM1Q08AH1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSM1Q08AH1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSM1Q08AH1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSM1Q08AH1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACSM1Q08AH1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACSM1Q08AH1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACSM1Q08AH1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACSM1Q08AH1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACSM1Q08AH1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACSM1Q08AH1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACSM1Q08AH1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACSM1Q08AH1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACSM1Q08AH1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACSM1Q08AH1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACSM1Q08AH1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACSM1Q08AH1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACSM1Q08AH1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACSM1Q08AH1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACSM1Q08AH1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACSM1Q08AH1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACSM1Q08AH1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACSM1Q08AH1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACSM1Q08AH1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACSM1Q08AH1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACSM1Q08AH1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACSM1Q08AH1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACSM1Q08AH1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACSM1Q08AH1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACSM1Q08AH1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACSM1Q08AH1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ACSM1Q08AH1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACSM1Q08AH1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACSM1Q08AH1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACSM1Q08AH1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACSM1Q08AH1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACSM1Q08AH1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACSM1Q08AH1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACSM1Q08AH1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ACSM1Q08AH1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ACSM1Q08AH1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ACSM1Q08AH1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSM1Q08AH1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSM1Q08AH1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSM1Q08AH1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSM1Q08AH1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSM1Q08AH1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSM1Q08AH1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACSM1Q08AH1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSM1Q08AH1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSM1Q08AH1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSM1Q08AH1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACSM1Q08AH1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSM1Q08AH1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSM1Q08AH1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSM1Q08AH1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSM1Q08AH1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSM1Q08AH1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSM1Q08AH1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSM1Q08AH1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSM1Q08AH1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSM1Q08AH1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSM1Q08AH1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSM1Q08AH1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSM1Q08AH1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSM1Q08AH1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSM1Q08AH1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSM1Q08AH1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSM1Q08AH1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSM1Q08AH1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSM1Q08AH1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSM1Q08AH1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSM1Q08AH1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSM1Q08AH1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSM1Q08AH1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSM1Q08AH1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSM1Q08AH1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSM1Q08AH1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSM1Q08AH1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSM1Q08AH1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSM1Q08AH1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSM1Q08AH1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSM1Q08AH1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSM1Q08AH1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSM1Q08AH1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSM1Q08AH1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms