Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RELAQ04206 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RELAQ04206 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RELAQ04206 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RELAQ04206 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RELAQ04206 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RELAQ04206 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RELAQ04206 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RELAQ04206 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RELAQ04206 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RELAQ04206 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RELAQ04206 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RELAQ04206 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RELAQ04206 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RELAQ04206 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RELAQ04206 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RELAQ04206 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RELAQ04206 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RELAQ04206 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RELAQ04206 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RELAQ04206 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RELAQ04206 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RELAQ04206 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RELAQ04206 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RELAQ04206 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RELAQ04206 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RELAQ04206 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RELAQ04206 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RELAQ04206 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RELAQ04206 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RELAQ04206 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RELAQ04206 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RELAQ04206 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RELAQ04206 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
RELAQ04206 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RELAQ04206 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RELAQ04206 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RELAQ04206 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RELAQ04206 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RELAQ04206 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RELAQ04206 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RELAQ04206 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RELAQ04206 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RELAQ04206 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RELAQ04206 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RELAQ04206 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RELAQ04206 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RELAQ04206 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RELAQ04206 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RELAQ04206 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RELAQ04206 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RELAQ04206 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RELAQ04206 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RELAQ04206 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RELAQ04206 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RELAQ04206 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RELAQ04206 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RELAQ04206 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RELAQ04206 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RELAQ04206 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RELAQ04206 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RELAQ04206 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RELAQ04206 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RELAQ04206 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RELAQ04206 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RELAQ04206 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RELAQ04206 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RELAQ04206 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RELAQ04206 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RELAQ04206 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RELAQ04206 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RELAQ04206 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RELAQ04206 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RELAQ04206 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RELAQ04206 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RELAQ04206 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RELAQ04206 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RELAQ04206 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RELAQ04206 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RELAQ04206 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RELAQ04206 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RELAQ04206 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RELAQ04206 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RELAQ04206 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RELAQ04206 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RELAQ04206 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RELAQ04206 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RELAQ04206 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RELAQ04206 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RELAQ04206 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RELAQ04206 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RELAQ04206 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RELAQ04206 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RELAQ04206 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RELAQ04206 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RELAQ04206 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RELAQ04206 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RELAQ04206 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RELAQ04206 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RELAQ04206 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms