Protein–RNA interactions for Protein: Q03403

TFF2, Trefoil factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF2Q03403 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TFF2Q03403 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TFF2Q03403 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TFF2Q03403 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TFF2Q03403 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TFF2Q03403 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TFF2Q03403 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TFF2Q03403 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TFF2Q03403 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TFF2Q03403 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TFF2Q03403 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TFF2Q03403 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TFF2Q03403 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TFF2Q03403 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TFF2Q03403 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TFF2Q03403 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TFF2Q03403 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TFF2Q03403 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TFF2Q03403 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TFF2Q03403 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TFF2Q03403 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TFF2Q03403 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TFF2Q03403 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TFF2Q03403 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TFF2Q03403 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TFF2Q03403 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TFF2Q03403 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TFF2Q03403 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TFF2Q03403 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TFF2Q03403 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TFF2Q03403 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TFF2Q03403 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TFF2Q03403 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TFF2Q03403 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TFF2Q03403 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TFF2Q03403 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TFF2Q03403 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TFF2Q03403 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TFF2Q03403 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TFF2Q03403 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TFF2Q03403 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TFF2Q03403 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TFF2Q03403 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TFF2Q03403 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TFF2Q03403 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TFF2Q03403 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TFF2Q03403 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TFF2Q03403 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TFF2Q03403 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TFF2Q03403 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TFF2Q03403 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TFF2Q03403 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TFF2Q03403 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFF2Q03403 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFF2Q03403 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFF2Q03403 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFF2Q03403 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFF2Q03403 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFF2Q03403 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFF2Q03403 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFF2Q03403 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFF2Q03403 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFF2Q03403 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFF2Q03403 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TFF2Q03403 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFF2Q03403 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TFF2Q03403 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TFF2Q03403 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TFF2Q03403 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TFF2Q03403 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TFF2Q03403 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFF2Q03403 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFF2Q03403 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFF2Q03403 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFF2Q03403 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TFF2Q03403 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TFF2Q03403 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TFF2Q03403 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TFF2Q03403 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TFF2Q03403 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TFF2Q03403 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TFF2Q03403 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TFF2Q03403 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TFF2Q03403 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TFF2Q03403 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TFF2Q03403 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TFF2Q03403 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TFF2Q03403 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TFF2Q03403 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TFF2Q03403 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TFF2Q03403 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TFF2Q03403 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms