Protein–RNA interactions for Protein: Q03169

TNFAIP2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP2Q03169 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNFAIP2Q03169 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNFAIP2Q03169 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNFAIP2Q03169 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNFAIP2Q03169 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNFAIP2Q03169 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNFAIP2Q03169 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNFAIP2Q03169 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNFAIP2Q03169 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNFAIP2Q03169 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNFAIP2Q03169 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNFAIP2Q03169 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNFAIP2Q03169 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNFAIP2Q03169 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFAIP2Q03169 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFAIP2Q03169 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFAIP2Q03169 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFAIP2Q03169 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNFAIP2Q03169 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNFAIP2Q03169 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TNFAIP2Q03169 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNFAIP2Q03169 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TNFAIP2Q03169 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TNFAIP2Q03169 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNFAIP2Q03169 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TNFAIP2Q03169 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNFAIP2Q03169 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNFAIP2Q03169 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNFAIP2Q03169 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TNFAIP2Q03169 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TNFAIP2Q03169 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TNFAIP2Q03169 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNFAIP2Q03169 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNFAIP2Q03169 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TNFAIP2Q03169 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TNFAIP2Q03169 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
TNFAIP2Q03169 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNFAIP2Q03169 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TNFAIP2Q03169 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TNFAIP2Q03169 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNFAIP2Q03169 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TNFAIP2Q03169 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TNFAIP2Q03169 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
TNFAIP2Q03169 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNFAIP2Q03169 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNFAIP2Q03169 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TNFAIP2Q03169 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNFAIP2Q03169 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNFAIP2Q03169 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNFAIP2Q03169 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TNFAIP2Q03169 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNFAIP2Q03169 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNFAIP2Q03169 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNFAIP2Q03169 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNFAIP2Q03169 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNFAIP2Q03169 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNFAIP2Q03169 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNFAIP2Q03169 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNFAIP2Q03169 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNFAIP2Q03169 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNFAIP2Q03169 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNFAIP2Q03169 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNFAIP2Q03169 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TNFAIP2Q03169 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNFAIP2Q03169 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNFAIP2Q03169 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNFAIP2Q03169 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TNFAIP2Q03169 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNFAIP2Q03169 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNFAIP2Q03169 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNFAIP2Q03169 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNFAIP2Q03169 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNFAIP2Q03169 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNFAIP2Q03169 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNFAIP2Q03169 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNFAIP2Q03169 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNFAIP2Q03169 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNFAIP2Q03169 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNFAIP2Q03169 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNFAIP2Q03169 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNFAIP2Q03169 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TNFAIP2Q03169 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNFAIP2Q03169 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TNFAIP2Q03169 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNFAIP2Q03169 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNFAIP2Q03169 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNFAIP2Q03169 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNFAIP2Q03169 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNFAIP2Q03169 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNFAIP2Q03169 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNFAIP2Q03169 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNFAIP2Q03169 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNFAIP2Q03169 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFAIP2Q03169 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFAIP2Q03169 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFAIP2Q03169 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFAIP2Q03169 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFAIP2Q03169 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFAIP2Q03169 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNFAIP2Q03169 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.2 ms