Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DSC2Q02487 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DSC2Q02487 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DSC2Q02487 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DSC2Q02487 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DSC2Q02487 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DSC2Q02487 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DSC2Q02487 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DSC2Q02487 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DSC2Q02487 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DSC2Q02487 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DSC2Q02487 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DSC2Q02487 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DSC2Q02487 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DSC2Q02487 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSC2Q02487 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSC2Q02487 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSC2Q02487 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DSC2Q02487 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSC2Q02487 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSC2Q02487 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DSC2Q02487 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DSC2Q02487 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DSC2Q02487 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DSC2Q02487 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DSC2Q02487 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DSC2Q02487 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DSC2Q02487 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DSC2Q02487 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DSC2Q02487 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DSC2Q02487 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DSC2Q02487 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DSC2Q02487 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DSC2Q02487 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DSC2Q02487 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DSC2Q02487 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSC2Q02487 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSC2Q02487 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSC2Q02487 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSC2Q02487 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSC2Q02487 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSC2Q02487 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSC2Q02487 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DSC2Q02487 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DSC2Q02487 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DSC2Q02487 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DSC2Q02487 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DSC2Q02487 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DSC2Q02487 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DSC2Q02487 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DSC2Q02487 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DSC2Q02487 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
DSC2Q02487 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DSC2Q02487 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DSC2Q02487 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSC2Q02487 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
DSC2Q02487 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSC2Q02487 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSC2Q02487 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
DSC2Q02487 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSC2Q02487 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSC2Q02487 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSC2Q02487 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSC2Q02487 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSC2Q02487 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSC2Q02487 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DSC2Q02487 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DSC2Q02487 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DSC2Q02487 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DSC2Q02487 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DSC2Q02487 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DSC2Q02487 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
DSC2Q02487 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DSC2Q02487 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DSC2Q02487 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DSC2Q02487 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DSC2Q02487 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DSC2Q02487 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
DSC2Q02487 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DSC2Q02487 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DSC2Q02487 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DSC2Q02487 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DSC2Q02487 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DSC2Q02487 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DSC2Q02487 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DSC2Q02487 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DSC2Q02487 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DSC2Q02487 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DSC2Q02487 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DSC2Q02487 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DSC2Q02487 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DSC2Q02487 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DSC2Q02487 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DSC2Q02487 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DSC2Q02487 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DSC2Q02487 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DSC2Q02487 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DSC2Q02487 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DSC2Q02487 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DSC2Q02487 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms