Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK3Q00526 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK3Q00526 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK3Q00526 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK3Q00526 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK3Q00526 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK3Q00526 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK3Q00526 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK3Q00526 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK3Q00526 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK3Q00526 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK3Q00526 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK3Q00526 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK3Q00526 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK3Q00526 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK3Q00526 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK3Q00526 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK3Q00526 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK3Q00526 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK3Q00526 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK3Q00526 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK3Q00526 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK3Q00526 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK3Q00526 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK3Q00526 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK3Q00526 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK3Q00526 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK3Q00526 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK3Q00526 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK3Q00526 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK3Q00526 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK3Q00526 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK3Q00526 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK3Q00526 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK3Q00526 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK3Q00526 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK3Q00526 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK3Q00526 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK3Q00526 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK3Q00526 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK3Q00526 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK3Q00526 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK3Q00526 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK3Q00526 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK3Q00526 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK3Q00526 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK3Q00526 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK3Q00526 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK3Q00526 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK3Q00526 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK3Q00526 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK3Q00526 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK3Q00526 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms