Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP2C1P98194 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP2C1P98194 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP2C1P98194 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP2C1P98194 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP2C1P98194 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP2C1P98194 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP2C1P98194 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP2C1P98194 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP2C1P98194 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP2C1P98194 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP2C1P98194 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP2C1P98194 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP2C1P98194 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP2C1P98194 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP2C1P98194 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP2C1P98194 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP2C1P98194 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP2C1P98194 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP2C1P98194 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP2C1P98194 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP2C1P98194 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP2C1P98194 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP2C1P98194 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP2C1P98194 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP2C1P98194 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP2C1P98194 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP2C1P98194 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP2C1P98194 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP2C1P98194 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP2C1P98194 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP2C1P98194 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP2C1P98194 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP2C1P98194 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP2C1P98194 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP2C1P98194 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP2C1P98194 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP2C1P98194 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP2C1P98194 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP2C1P98194 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP2C1P98194 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP2C1P98194 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP2C1P98194 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP2C1P98194 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP2C1P98194 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP2C1P98194 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP2C1P98194 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP2C1P98194 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP2C1P98194 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP2C1P98194 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP2C1P98194 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP2C1P98194 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP2C1P98194 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP2C1P98194 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP2C1P98194 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ATP2C1P98194 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP2C1P98194 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP2C1P98194 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP2C1P98194 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP2C1P98194 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP2C1P98194 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP2C1P98194 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP2C1P98194 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP2C1P98194 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP2C1P98194 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2C1P98194 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2C1P98194 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2C1P98194 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2C1P98194 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2C1P98194 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2C1P98194 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2C1P98194 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ATP2C1P98194 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP2C1P98194 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP2C1P98194 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP2C1P98194 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP2C1P98194 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP2C1P98194 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP2C1P98194 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP2C1P98194 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ATP2C1P98194 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP2C1P98194 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP2C1P98194 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP2C1P98194 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP2C1P98194 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ATP2C1P98194 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ATP2C1P98194 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ATP2C1P98194 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP2C1P98194 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP2C1P98194 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP2C1P98194 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP2C1P98194 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP2C1P98194 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP2C1P98194 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP2C1P98194 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP2C1P98194 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP2C1P98194 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP2C1P98194 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP2C1P98194 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP2C1P98194 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms