Protein–RNA interactions for Protein: P78344

EIF4G2, Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4G2P78344 ELP4-213ENST00000638828 4647 ntTSL 24.12□□□□□ -1.751e-10■■■■■ 44.8
EIF4G2P78344 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.016e-7■■■■■ 44.8
EIF4G2P78344 KDM4B-205ENST00000588337 504 ntTSL 537.37■■■■□ 3.574e-7■■■■■ 44.7
EIF4G2P78344 GTF2IRD1-207ENST00000489094 2274 ntTSL 523.64■■□□□ 1.372e-6■■■■■ 44.7
EIF4G2P78344 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.72e-6■■■■■ 44.7
EIF4G2P78344 ADARB1-207ENST00000460734 2523 ntTSL 1 (best)35.1■■■■□ 3.215e-7■■■■■ 44.7
EIF4G2P78344 ADARB1-208ENST00000462214 587 ntTSL 311.16□□□□□ -0.625e-7■■■■■ 44.7
EIF4G2P78344 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.222e-12■■■■■ 44.7
EIF4G2P78344 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.032e-12■■■■■ 44.7
EIF4G2P78344 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.412e-12■■■■■ 44.7
EIF4G2P78344 IQCE-206ENST00000422276 541 ntTSL 520.64■□□□□ 0.898e-7■■■■■ 44.6
EIF4G2P78344 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.867e-8■■■■■ 44.5
EIF4G2P78344 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.357e-8■■■■■ 44.5
EIF4G2P78344 EMID1-207ENST00000435427 482 ntTSL 535.62■■■■□ 3.297e-8■■■■■ 44.5
EIF4G2P78344 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.247e-8■■■■■ 44.5
EIF4G2P78344 EMID1-204ENST00000429226 769 ntTSL 532.35■■■□□ 2.777e-8■■■■■ 44.5
EIF4G2P78344 EMID1-205ENST00000430127 641 ntTSL 529.06■■■□□ 2.247e-8■■■■■ 44.5
EIF4G2P78344 RNFT2-206ENST00000551251 739 ntTSL 311.51□□□□□ -0.572e-6■■■■■ 44.4
EIF4G2P78344 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.631e-7■■■■■ 44.4
EIF4G2P78344 GALNT7-206ENST00000512285 1567 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 44.4
EIF4G2P78344 NUP188-209ENST00000491990 381 ntTSL 532.01■■■□□ 2.711e-6■■■■■ 44.4
EIF4G2P78344 NUP188-211ENST00000550219 886 ntTSL 1 (best)18.47■□□□□ 0.551e-6■■■■■ 44.4
EIF4G2P78344 AL672142.1-201ENST00000482796 378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.341e-6■■■■■ 44.4
EIF4G2P78344 CARD11-202ENST00000356408 584 ntTSL 329.43■■■□□ 2.37e-8■■■■■ 44.3
EIF4G2P78344 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.027e-8■■■■■ 44.3
EIF4G2P78344 MICALL2-202ENST00000413446 3046 ntTSL 218.91■□□□□ 0.622e-8■■■■■ 44.3
EIF4G2P78344 NPHP4-209ENST00000489180 5548 ntTSL 223.42■■□□□ 1.342e-7■■■■■ 44.3
EIF4G2P78344 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.832e-7■■■■■ 44.3
EIF4G2P78344 NPHP4-208ENST00000478423 4467 ntTSL 219.36■□□□□ 0.692e-7■■■■■ 44.3
EIF4G2P78344 NPHP4-203ENST00000378169 4213 ntTSL 1 (best)18.05■□□□□ 0.482e-7■■■■■ 44.3
EIF4G2P78344 ATP2A3-215ENST00000576957 1159 ntTSL 218.14■□□□□ 0.491e-9■■■■■ 44.2
EIF4G2P78344 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.174e-7■■■■■ 44.2
EIF4G2P78344 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.38e-9■■■■■ 44.1
EIF4G2P78344 PSMD5-201ENST00000210313 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.488e-9■■■■■ 44.1
EIF4G2P78344 PSMD5-207ENST00000496688 384 ntTSL 313.59□□□□□ -0.238e-9■■■■■ 44.1
EIF4G2P78344 AGAP1-203ENST00000402604 563 ntTSL 417.03■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 44.1
EIF4G2P78344 TRAPPC9-215ENST00000524162 591 ntTSL 429.2■■■□□ 2.268e-7■■■■■ 44
EIF4G2P78344 TRAPPC9-213ENST00000522504 665 ntTSL 320.97■□□□□ 0.958e-7■■■■■ 44
EIF4G2P78344 TRAPPC9-206ENST00000519482 551 ntTSL 417.21■□□□□ 0.358e-7■■■■■ 44
EIF4G2P78344 PFKFB4-208ENST00000452531 1011 ntTSL 525.39■■□□□ 1.661e-9■■■■■ 44
EIF4G2P78344 PFKFB4-206ENST00000422701 636 ntTSL 321.89■■□□□ 1.091e-9■■■■■ 44
EIF4G2P78344 PFKFB4-215ENST00000496767 779 ntTSL 521.22■□□□□ 0.991e-9■■■■■ 44
EIF4G2P78344 PFKFB4-209ENST00000467176 643 ntTSL 320.1■□□□□ 0.811e-9■■■■■ 44
EIF4G2P78344 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.396e-7■■■■■ 44
EIF4G2P78344 PDXK-212ENST00000470029 583 ntTSL 327.35■■□□□ 1.976e-7■■■■■ 44
EIF4G2P78344 PDXK-207ENST00000438837 342 ntTSL 311.59□□□□□ -0.556e-7■■■■■ 44
EIF4G2P78344 PISD-213ENST00000474017 1760 ntTSL 525.2■■□□□ 1.629e-8■■■■■ 44
EIF4G2P78344 PISD-212ENST00000473770 2378 ntTSL 522.75■■□□□ 1.239e-8■■■■■ 44
EIF4G2P78344 PISD-217ENST00000491342 692 ntTSL 520.88■□□□□ 0.939e-8■■■■■ 44
EIF4G2P78344 PISD-206ENST00000431201 460 ntTSL 420.61■□□□□ 0.899e-8■■■■■ 44
EIF4G2P78344 PISD-205ENST00000429683 609 ntTSL 320.61■□□□□ 0.899e-8■■■■■ 44
EIF4G2P78344 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.849e-8■■■■■ 44
EIF4G2P78344 PISD-211ENST00000460723 2534 ntTSL 1 (best)19.48■□□□□ 0.719e-8■■■■■ 44
EIF4G2P78344 PISD-203ENST00000397500 2194 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.549e-8■■■■■ 44
EIF4G2P78344 PISD-202ENST00000382151 2669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.379e-8■■■■■ 44
EIF4G2P78344 PISD-208ENST00000437808 2264 ntTSL 516.94■□□□□ 0.39e-8■■■■■ 44
EIF4G2P78344 PISD-207ENST00000435900 1723 ntTSL 515.7■□□□□ 0.19e-8■■■■■ 44
EIF4G2P78344 PISD-204ENST00000422020 1015 ntTSL 515.47■□□□□ 0.079e-8■■■■■ 44
EIF4G2P78344 PISD-201ENST00000266095 2655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.079e-8■■■■■ 44
EIF4G2P78344 CMSS1-208ENST00000496116 2145 ntTSL 1 (best)15.56■□□□□ 0.082e-8■■■■■ 43.9
EIF4G2P78344 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.91e-6■■■■■ 43.8
EIF4G2P78344 ARHGAP35-202ENST00000595822 2977 ntTSL 217.36■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 43.8
EIF4G2P78344 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.121e-6■■■■■ 43.8
EIF4G2P78344 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.473e-7■■■■■ 43.8
EIF4G2P78344 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.663e-7■■■■■ 43.8
EIF4G2P78344 GABRG3-204ENST00000554696 774 ntTSL 310.9□□□□□ -0.663e-7■■■■■ 43.8
EIF4G2P78344 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.143e-7■■■■■ 43.8
EIF4G2P78344 TRAPPC9-214ENST00000523777 705 ntTSL 322.66■■□□□ 1.227e-7■■■■■ 43.8
EIF4G2P78344 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.474e-9■■■■■ 43.8
EIF4G2P78344 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.524e-9■■■■■ 43.8
EIF4G2P78344 ADARB1-212ENST00000496664 5033 ntTSL 1 (best)29.15■■■□□ 2.268e-7■■■■■ 43.8
EIF4G2P78344 ADARB1-203ENST00000389861 5031 ntTSL 1 (best)29.15■■■□□ 2.268e-7■■■■■ 43.8
EIF4G2P78344 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.268e-7■■■■■ 43.8
EIF4G2P78344 ADARB1-211ENST00000492414 4913 ntTSL 1 (best)27.97■■■□□ 2.078e-7■■■■■ 43.8
EIF4G2P78344 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.448e-7■■■■■ 43.8
EIF4G2P78344 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.388e-7■■■■■ 43.8
EIF4G2P78344 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.85e-13■■■■■ 43.8
EIF4G2P78344 PLCL1-202ENST00000435320 6665 ntTSL 223.58■■□□□ 1.375e-13■■■■■ 43.8
EIF4G2P78344 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.762e-7■■■■■ 43.7
EIF4G2P78344 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.262e-7■■■■■ 43.7
EIF4G2P78344 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.172e-7■■■■■ 43.7
EIF4G2P78344 PDCD6-203ENST00000505526 1484 ntTSL 1 (best)21.96■■□□□ 1.112e-7■■■■■ 43.7
EIF4G2P78344 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.12e-7■■■■■ 43.7
EIF4G2P78344 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.612e-7■■■■■ 43.7
EIF4G2P78344 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.612e-7■■■■■ 43.7
EIF4G2P78344 PDCD6-210ENST00000513582 3500 ntTSL 214.78□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 43.7
EIF4G2P78344 PDCD6-205ENST00000507473 486 ntTSL 311□□□□□ -0.652e-7■■■■■ 43.7
EIF4G2P78344 ZNF562-203ENST00000585350 577 ntTSL 520.98■□□□□ 0.954e-13■■■■■ 43.7
EIF4G2P78344 ZNF562-208ENST00000590155 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.54e-13■■■■■ 43.7
EIF4G2P78344 ZNF562-207ENST00000589542 491 ntTSL 310.56□□□□□ -0.724e-13■■■■■ 43.7
EIF4G2P78344 ZNF562-206ENST00000588653 585 ntTSL 29.75□□□□□ -0.854e-13■■■■■ 43.7
EIF4G2P78344 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.874e-13■■■■■ 43.7
EIF4G2P78344 ZNF562-204ENST00000585688 1475 ntTSL 28.17□□□□□ -1.14e-13■■■■■ 43.7
EIF4G2P78344 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.344e-13■■■■■ 43.7
EIF4G2P78344 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.554e-13■■■■■ 43.7
EIF4G2P78344 ASMTL-AS1-201ENST00000419737 553 ntTSL 218.99■□□□□ 0.636e-7■■■■■ 43.7
EIF4G2P78344 ASMTL-AS1-205ENST00000602357 435 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.116e-7■■■■■ 43.7
EIF4G2P78344 ASMTL-AS1-202ENST00000420411 697 ntTSL 1 (best)15.62■□□□□ 0.096e-7■■■■■ 43.7
EIF4G2P78344 IQCE-202ENST00000325997 2235 ntTSL 1 (best)29.68■■■□□ 2.349e-7■■■■■ 43.5
EIF4G2P78344 IQCE-205ENST00000415271 899 ntTSL 529.41■■■□□ 2.39e-7■■■■■ 43.5
Retrieved 100 of 8,962 protein–RNA pairs in 481.7 ms