Protein–RNA interactions for Protein: P62875

POLR2L, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2LP62875 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2LP62875 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2LP62875 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2LP62875 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2LP62875 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2LP62875 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2LP62875 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2LP62875 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2LP62875 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2LP62875 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2LP62875 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2LP62875 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2LP62875 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2LP62875 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2LP62875 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2LP62875 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2LP62875 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2LP62875 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2LP62875 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2LP62875 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2LP62875 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2LP62875 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2LP62875 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2LP62875 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2LP62875 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2LP62875 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR2LP62875 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
POLR2LP62875 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2LP62875 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2LP62875 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2LP62875 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2LP62875 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2LP62875 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2LP62875 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2LP62875 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2LP62875 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2LP62875 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2LP62875 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2LP62875 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2LP62875 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2LP62875 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2LP62875 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2LP62875 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2LP62875 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2LP62875 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2LP62875 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2LP62875 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2LP62875 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2LP62875 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2LP62875 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2LP62875 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2LP62875 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2LP62875 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2LP62875 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2LP62875 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2LP62875 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2LP62875 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2LP62875 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2LP62875 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2LP62875 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2LP62875 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2LP62875 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2LP62875 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2LP62875 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2LP62875 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2LP62875 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2LP62875 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR2LP62875 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR2LP62875 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR2LP62875 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR2LP62875 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR2LP62875 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR2LP62875 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR2LP62875 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2LP62875 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2LP62875 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2LP62875 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2LP62875 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2LP62875 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2LP62875 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2LP62875 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2LP62875 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2LP62875 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2LP62875 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2LP62875 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2LP62875 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2LP62875 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2LP62875 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2LP62875 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2LP62875 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2LP62875 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2LP62875 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2LP62875 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2LP62875 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2LP62875 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2LP62875 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2LP62875 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2LP62875 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2LP62875 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2LP62875 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms