Protein–RNA interactions for Protein: P60174

TPI1, Triosephosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPI1P60174 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPI1P60174 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPI1P60174 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPI1P60174 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPI1P60174 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPI1P60174 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPI1P60174 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPI1P60174 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPI1P60174 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TPI1P60174 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPI1P60174 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPI1P60174 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPI1P60174 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TPI1P60174 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPI1P60174 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPI1P60174 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPI1P60174 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPI1P60174 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPI1P60174 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPI1P60174 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPI1P60174 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPI1P60174 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPI1P60174 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPI1P60174 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPI1P60174 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPI1P60174 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPI1P60174 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPI1P60174 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPI1P60174 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPI1P60174 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPI1P60174 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPI1P60174 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPI1P60174 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPI1P60174 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPI1P60174 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPI1P60174 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPI1P60174 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPI1P60174 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPI1P60174 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPI1P60174 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPI1P60174 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPI1P60174 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPI1P60174 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TPI1P60174 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPI1P60174 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPI1P60174 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TPI1P60174 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPI1P60174 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TPI1P60174 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TPI1P60174 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TPI1P60174 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TPI1P60174 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TPI1P60174 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TPI1P60174 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TPI1P60174 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TPI1P60174 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TPI1P60174 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPI1P60174 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPI1P60174 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPI1P60174 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPI1P60174 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPI1P60174 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPI1P60174 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TPI1P60174 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TPI1P60174 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPI1P60174 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPI1P60174 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPI1P60174 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPI1P60174 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPI1P60174 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TPI1P60174 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPI1P60174 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPI1P60174 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPI1P60174 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPI1P60174 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPI1P60174 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPI1P60174 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPI1P60174 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPI1P60174 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPI1P60174 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPI1P60174 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPI1P60174 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPI1P60174 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPI1P60174 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPI1P60174 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TPI1P60174 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPI1P60174 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPI1P60174 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPI1P60174 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPI1P60174 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TPI1P60174 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TPI1P60174 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPI1P60174 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPI1P60174 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPI1P60174 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPI1P60174 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TPI1P60174 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPI1P60174 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPI1P60174 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPI1P60174 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms