Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB25P57735 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB25P57735 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB25P57735 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB25P57735 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB25P57735 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB25P57735 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB25P57735 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB25P57735 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB25P57735 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB25P57735 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB25P57735 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB25P57735 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB25P57735 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB25P57735 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB25P57735 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB25P57735 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB25P57735 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB25P57735 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB25P57735 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB25P57735 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB25P57735 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB25P57735 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB25P57735 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB25P57735 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB25P57735 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB25P57735 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB25P57735 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB25P57735 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB25P57735 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB25P57735 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB25P57735 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB25P57735 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB25P57735 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB25P57735 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB25P57735 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB25P57735 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB25P57735 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB25P57735 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RAB25P57735 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB25P57735 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB25P57735 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB25P57735 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB25P57735 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB25P57735 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB25P57735 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB25P57735 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB25P57735 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB25P57735 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB25P57735 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB25P57735 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB25P57735 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB25P57735 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB25P57735 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB25P57735 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB25P57735 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB25P57735 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB25P57735 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB25P57735 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB25P57735 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB25P57735 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB25P57735 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB25P57735 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB25P57735 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB25P57735 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB25P57735 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB25P57735 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB25P57735 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB25P57735 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB25P57735 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB25P57735 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB25P57735 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB25P57735 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB25P57735 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB25P57735 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB25P57735 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB25P57735 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB25P57735 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB25P57735 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB25P57735 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB25P57735 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB25P57735 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB25P57735 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB25P57735 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB25P57735 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB25P57735 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB25P57735 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB25P57735 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB25P57735 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB25P57735 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB25P57735 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB25P57735 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB25P57735 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB25P57735 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB25P57735 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB25P57735 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB25P57735 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB25P57735 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB25P57735 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB25P57735 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms