Protein–RNA interactions for Protein: P56385

ATP5I, ATP synthase subunit e, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5IP56385 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5IP56385 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5IP56385 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP5IP56385 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5IP56385 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5IP56385 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5IP56385 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP5IP56385 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5IP56385 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5IP56385 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5IP56385 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5IP56385 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5IP56385 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5IP56385 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP5IP56385 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATP5IP56385 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP5IP56385 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP5IP56385 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP5IP56385 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP5IP56385 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP5IP56385 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP5IP56385 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP5IP56385 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP5IP56385 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP5IP56385 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP5IP56385 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP5IP56385 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP5IP56385 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP5IP56385 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP5IP56385 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP5IP56385 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5IP56385 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5IP56385 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5IP56385 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5IP56385 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5IP56385 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5IP56385 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5IP56385 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5IP56385 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP5IP56385 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5IP56385 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5IP56385 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5IP56385 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5IP56385 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5IP56385 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5IP56385 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5IP56385 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5IP56385 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP5IP56385 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5IP56385 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5IP56385 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5IP56385 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5IP56385 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP5IP56385 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms