Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
AP3M2P53677 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
AP3M2P53677 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
AP3M2P53677 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AP3M2P53677 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AP3M2P53677 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AP3M2P53677 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AP3M2P53677 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AP3M2P53677 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AP3M2P53677 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AP3M2P53677 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AP3M2P53677 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AP3M2P53677 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AP3M2P53677 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AP3M2P53677 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
AP3M2P53677 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
AP3M2P53677 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AP3M2P53677 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AP3M2P53677 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AP3M2P53677 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AP3M2P53677 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AP3M2P53677 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AP3M2P53677 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AP3M2P53677 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AP3M2P53677 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AP3M2P53677 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AP3M2P53677 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
AP3M2P53677 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AP3M2P53677 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AP3M2P53677 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AP3M2P53677 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AP3M2P53677 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AP3M2P53677 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AP3M2P53677 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AP3M2P53677 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AP3M2P53677 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AP3M2P53677 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AP3M2P53677 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AP3M2P53677 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
AP3M2P53677 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
AP3M2P53677 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AP3M2P53677 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
AP3M2P53677 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AP3M2P53677 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AP3M2P53677 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AP3M2P53677 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AP3M2P53677 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AP3M2P53677 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AP3M2P53677 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AP3M2P53677 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AP3M2P53677 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AP3M2P53677 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AP3M2P53677 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AP3M2P53677 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AP3M2P53677 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AP3M2P53677 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AP3M2P53677 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AP3M2P53677 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AP3M2P53677 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AP3M2P53677 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AP3M2P53677 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AP3M2P53677 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
AP3M2P53677 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AP3M2P53677 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AP3M2P53677 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AP3M2P53677 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AP3M2P53677 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
AP3M2P53677 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AP3M2P53677 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
AP3M2P53677 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AP3M2P53677 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
AP3M2P53677 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AP3M2P53677 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AP3M2P53677 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AP3M2P53677 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AP3M2P53677 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AP3M2P53677 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AP3M2P53677 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
AP3M2P53677 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
AP3M2P53677 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
AP3M2P53677 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
AP3M2P53677 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
AP3M2P53677 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AP3M2P53677 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
AP3M2P53677 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AP3M2P53677 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
AP3M2P53677 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AP3M2P53677 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
AP3M2P53677 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AP3M2P53677 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
AP3M2P53677 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
AP3M2P53677 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
AP3M2P53677 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AP3M2P53677 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
AP3M2P53677 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AP3M2P53677 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AP3M2P53677 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AP3M2P53677 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AP3M2P53677 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AP3M2P53677 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms