Protein–RNA interactions for Protein: P53384

NUBP1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP1P53384 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUBP1P53384 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NUBP1P53384 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUBP1P53384 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUBP1P53384 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUBP1P53384 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUBP1P53384 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUBP1P53384 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUBP1P53384 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUBP1P53384 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUBP1P53384 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUBP1P53384 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUBP1P53384 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUBP1P53384 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUBP1P53384 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUBP1P53384 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUBP1P53384 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUBP1P53384 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUBP1P53384 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUBP1P53384 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NUBP1P53384 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUBP1P53384 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUBP1P53384 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUBP1P53384 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUBP1P53384 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUBP1P53384 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUBP1P53384 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUBP1P53384 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NUBP1P53384 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NUBP1P53384 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NUBP1P53384 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUBP1P53384 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUBP1P53384 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUBP1P53384 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUBP1P53384 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUBP1P53384 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUBP1P53384 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NUBP1P53384 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUBP1P53384 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUBP1P53384 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUBP1P53384 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUBP1P53384 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUBP1P53384 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUBP1P53384 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NUBP1P53384 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUBP1P53384 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NUBP1P53384 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NUBP1P53384 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUBP1P53384 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUBP1P53384 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUBP1P53384 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUBP1P53384 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUBP1P53384 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUBP1P53384 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUBP1P53384 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUBP1P53384 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUBP1P53384 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUBP1P53384 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUBP1P53384 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUBP1P53384 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUBP1P53384 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUBP1P53384 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NUBP1P53384 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUBP1P53384 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUBP1P53384 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NUBP1P53384 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUBP1P53384 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUBP1P53384 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUBP1P53384 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUBP1P53384 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUBP1P53384 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUBP1P53384 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUBP1P53384 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUBP1P53384 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUBP1P53384 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUBP1P53384 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUBP1P53384 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUBP1P53384 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUBP1P53384 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUBP1P53384 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUBP1P53384 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUBP1P53384 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUBP1P53384 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUBP1P53384 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NUBP1P53384 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUBP1P53384 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUBP1P53384 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NUBP1P53384 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUBP1P53384 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUBP1P53384 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUBP1P53384 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUBP1P53384 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NUBP1P53384 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NUBP1P53384 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NUBP1P53384 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NUBP1P53384 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUBP1P53384 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NUBP1P53384 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUBP1P53384 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUBP1P53384 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms