Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLCN3P51790 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLCN3P51790 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLCN3P51790 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLCN3P51790 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLCN3P51790 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CLCN3P51790 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLCN3P51790 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLCN3P51790 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLCN3P51790 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLCN3P51790 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLCN3P51790 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CLCN3P51790 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLCN3P51790 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLCN3P51790 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLCN3P51790 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CLCN3P51790 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLCN3P51790 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLCN3P51790 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLCN3P51790 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLCN3P51790 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLCN3P51790 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLCN3P51790 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLCN3P51790 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLCN3P51790 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CLCN3P51790 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLCN3P51790 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLCN3P51790 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLCN3P51790 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLCN3P51790 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLCN3P51790 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLCN3P51790 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLCN3P51790 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLCN3P51790 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CLCN3P51790 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLCN3P51790 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CLCN3P51790 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLCN3P51790 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLCN3P51790 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLCN3P51790 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLCN3P51790 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLCN3P51790 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLCN3P51790 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CLCN3P51790 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLCN3P51790 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLCN3P51790 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLCN3P51790 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLCN3P51790 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLCN3P51790 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLCN3P51790 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CLCN3P51790 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLCN3P51790 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CLCN3P51790 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLCN3P51790 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLCN3P51790 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLCN3P51790 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLCN3P51790 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLCN3P51790 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLCN3P51790 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLCN3P51790 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLCN3P51790 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLCN3P51790 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLCN3P51790 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLCN3P51790 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLCN3P51790 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLCN3P51790 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLCN3P51790 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLCN3P51790 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLCN3P51790 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLCN3P51790 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLCN3P51790 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLCN3P51790 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLCN3P51790 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLCN3P51790 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLCN3P51790 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLCN3P51790 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLCN3P51790 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLCN3P51790 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLCN3P51790 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CLCN3P51790 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLCN3P51790 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CLCN3P51790 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLCN3P51790 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLCN3P51790 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLCN3P51790 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLCN3P51790 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLCN3P51790 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLCN3P51790 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLCN3P51790 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLCN3P51790 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLCN3P51790 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLCN3P51790 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLCN3P51790 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLCN3P51790 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CLCN3P51790 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLCN3P51790 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLCN3P51790 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLCN3P51790 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLCN3P51790 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLCN3P51790 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 235.6 ms