Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB27AP51159 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB27AP51159 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB27AP51159 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB27AP51159 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB27AP51159 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB27AP51159 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB27AP51159 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB27AP51159 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB27AP51159 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB27AP51159 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB27AP51159 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB27AP51159 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB27AP51159 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB27AP51159 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB27AP51159 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB27AP51159 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB27AP51159 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB27AP51159 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB27AP51159 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB27AP51159 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB27AP51159 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB27AP51159 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAB27AP51159 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAB27AP51159 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAB27AP51159 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAB27AP51159 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAB27AP51159 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB27AP51159 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB27AP51159 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB27AP51159 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB27AP51159 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB27AP51159 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB27AP51159 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB27AP51159 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB27AP51159 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB27AP51159 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB27AP51159 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB27AP51159 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB27AP51159 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB27AP51159 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB27AP51159 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB27AP51159 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB27AP51159 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB27AP51159 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB27AP51159 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB27AP51159 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB27AP51159 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB27AP51159 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB27AP51159 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB27AP51159 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB27AP51159 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB27AP51159 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB27AP51159 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB27AP51159 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB27AP51159 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB27AP51159 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB27AP51159 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB27AP51159 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB27AP51159 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB27AP51159 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB27AP51159 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB27AP51159 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RAB27AP51159 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RAB27AP51159 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms