Protein–RNA interactions for Protein: P50402

EMD, Emerin, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMDP50402 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMDP50402 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMDP50402 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMDP50402 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMDP50402 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMDP50402 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMDP50402 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EMDP50402 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMDP50402 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMDP50402 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMDP50402 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMDP50402 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EMDP50402 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMDP50402 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMDP50402 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMDP50402 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMDP50402 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMDP50402 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMDP50402 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMDP50402 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMDP50402 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMDP50402 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMDP50402 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMDP50402 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMDP50402 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMDP50402 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMDP50402 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMDP50402 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMDP50402 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMDP50402 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMDP50402 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMDP50402 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMDP50402 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMDP50402 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMDP50402 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMDP50402 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EMDP50402 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EMDP50402 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EMDP50402 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EMDP50402 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EMDP50402 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EMDP50402 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EMDP50402 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
EMDP50402 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EMDP50402 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EMDP50402 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EMDP50402 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EMDP50402 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EMDP50402 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EMDP50402 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EMDP50402 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EMDP50402 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EMDP50402 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EMDP50402 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EMDP50402 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EMDP50402 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EMDP50402 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EMDP50402 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EMDP50402 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EMDP50402 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EMDP50402 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EMDP50402 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EMDP50402 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EMDP50402 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EMDP50402 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMDP50402 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EMDP50402 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMDP50402 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMDP50402 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMDP50402 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMDP50402 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMDP50402 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMDP50402 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMDP50402 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EMDP50402 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EMDP50402 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMDP50402 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EMDP50402 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EMDP50402 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EMDP50402 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EMDP50402 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EMDP50402 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EMDP50402 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EMDP50402 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMDP50402 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMDP50402 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMDP50402 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMDP50402 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMDP50402 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMDP50402 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMDP50402 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMDP50402 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMDP50402 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMDP50402 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMDP50402 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EMDP50402 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMDP50402 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMDP50402 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMDP50402 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMDP50402 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms