Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
NUP153P49790 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
NUP153P49790 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
NUP153P49790 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
NUP153P49790 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
NUP153P49790 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
NUP153P49790 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
NUP153P49790 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
NUP153P49790 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
NUP153P49790 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
NUP153P49790 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
NUP153P49790 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
NUP153P49790 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
NUP153P49790 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
NUP153P49790 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
NUP153P49790 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
NUP153P49790 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
NUP153P49790 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.62■■■■□ 3.77
NUP153P49790 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
NUP153P49790 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
NUP153P49790 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
NUP153P49790 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
NUP153P49790 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
NUP153P49790 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
NUP153P49790 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
NUP153P49790 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC38.59■■■■□ 3.77
NUP153P49790 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
NUP153P49790 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
NUP153P49790 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
NUP153P49790 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
NUP153P49790 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.76
NUP153P49790 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC38.57■■■■□ 3.76
NUP153P49790 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
NUP153P49790 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
NUP153P49790 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
NUP153P49790 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
NUP153P49790 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
NUP153P49790 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
NUP153P49790 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
NUP153P49790 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
NUP153P49790 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
NUP153P49790 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
NUP153P49790 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
NUP153P49790 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC38.54■■■■□ 3.76
NUP153P49790 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
NUP153P49790 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
NUP153P49790 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
NUP153P49790 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
NUP153P49790 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
NUP153P49790 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
NUP153P49790 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
NUP153P49790 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
NUP153P49790 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
NUP153P49790 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
NUP153P49790 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
NUP153P49790 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
NUP153P49790 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
NUP153P49790 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
NUP153P49790 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
NUP153P49790 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
NUP153P49790 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
NUP153P49790 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
NUP153P49790 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
NUP153P49790 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
NUP153P49790 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
NUP153P49790 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
NUP153P49790 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
NUP153P49790 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
NUP153P49790 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
NUP153P49790 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
NUP153P49790 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
NUP153P49790 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
NUP153P49790 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
NUP153P49790 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
NUP153P49790 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
NUP153P49790 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
NUP153P49790 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
NUP153P49790 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
NUP153P49790 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
NUP153P49790 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
NUP153P49790 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
NUP153P49790 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
NUP153P49790 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
NUP153P49790 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
NUP153P49790 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
NUP153P49790 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
NUP153P49790 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
NUP153P49790 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
NUP153P49790 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
NUP153P49790 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
NUP153P49790 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
NUP153P49790 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
NUP153P49790 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
NUP153P49790 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
NUP153P49790 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
NUP153P49790 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
NUP153P49790 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
NUP153P49790 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
NUP153P49790 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
NUP153P49790 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms