Protein–RNA interactions for Protein: P49763

PGF, Placenta growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGFP49763 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PGFP49763 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGFP49763 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGFP49763 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGFP49763 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGFP49763 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGFP49763 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PGFP49763 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGFP49763 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGFP49763 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGFP49763 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGFP49763 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGFP49763 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PGFP49763 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGFP49763 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGFP49763 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGFP49763 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGFP49763 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGFP49763 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PGFP49763 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGFP49763 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGFP49763 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGFP49763 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGFP49763 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGFP49763 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGFP49763 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGFP49763 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGFP49763 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGFP49763 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGFP49763 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGFP49763 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGFP49763 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGFP49763 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGFP49763 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGFP49763 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGFP49763 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGFP49763 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGFP49763 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGFP49763 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGFP49763 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGFP49763 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGFP49763 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGFP49763 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGFP49763 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGFP49763 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGFP49763 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGFP49763 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGFP49763 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGFP49763 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGFP49763 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGFP49763 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGFP49763 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGFP49763 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGFP49763 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGFP49763 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGFP49763 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGFP49763 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGFP49763 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGFP49763 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGFP49763 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGFP49763 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGFP49763 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGFP49763 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGFP49763 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGFP49763 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGFP49763 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGFP49763 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGFP49763 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PGFP49763 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PGFP49763 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PGFP49763 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PGFP49763 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PGFP49763 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGFP49763 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGFP49763 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGFP49763 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGFP49763 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGFP49763 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGFP49763 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGFP49763 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGFP49763 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGFP49763 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGFP49763 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGFP49763 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGFP49763 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGFP49763 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGFP49763 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGFP49763 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGFP49763 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGFP49763 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGFP49763 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGFP49763 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PGFP49763 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGFP49763 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGFP49763 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGFP49763 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGFP49763 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGFP49763 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGFP49763 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGFP49763 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms