Protein–RNA interactions for Protein: P49761

CLK3, Dual specificity protein kinase CLK3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK3P49761 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK3P49761 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK3P49761 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK3P49761 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLK3P49761 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLK3P49761 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLK3P49761 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLK3P49761 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLK3P49761 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLK3P49761 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLK3P49761 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLK3P49761 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLK3P49761 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLK3P49761 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLK3P49761 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLK3P49761 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLK3P49761 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLK3P49761 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLK3P49761 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLK3P49761 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLK3P49761 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLK3P49761 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLK3P49761 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLK3P49761 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLK3P49761 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLK3P49761 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLK3P49761 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLK3P49761 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLK3P49761 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLK3P49761 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLK3P49761 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLK3P49761 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLK3P49761 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLK3P49761 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLK3P49761 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLK3P49761 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLK3P49761 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLK3P49761 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLK3P49761 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLK3P49761 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLK3P49761 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLK3P49761 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLK3P49761 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLK3P49761 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK3P49761 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK3P49761 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK3P49761 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK3P49761 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK3P49761 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLK3P49761 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CLK3P49761 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLK3P49761 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLK3P49761 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLK3P49761 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLK3P49761 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLK3P49761 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLK3P49761 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLK3P49761 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLK3P49761 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK3P49761 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK3P49761 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK3P49761 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK3P49761 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLK3P49761 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLK3P49761 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLK3P49761 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLK3P49761 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLK3P49761 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLK3P49761 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLK3P49761 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLK3P49761 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLK3P49761 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLK3P49761 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLK3P49761 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLK3P49761 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLK3P49761 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLK3P49761 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLK3P49761 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLK3P49761 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLK3P49761 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLK3P49761 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLK3P49761 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLK3P49761 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLK3P49761 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLK3P49761 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLK3P49761 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLK3P49761 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLK3P49761 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLK3P49761 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLK3P49761 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLK3P49761 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLK3P49761 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLK3P49761 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLK3P49761 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLK3P49761 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLK3P49761 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLK3P49761 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLK3P49761 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLK3P49761 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLK3P49761 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms