Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
PRIM1P49642 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
PRIM1P49642 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PRIM1P49642 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PRIM1P49642 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PRIM1P49642 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PRIM1P49642 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PRIM1P49642 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRIM1P49642 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRIM1P49642 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRIM1P49642 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRIM1P49642 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRIM1P49642 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
PRIM1P49642 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRIM1P49642 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRIM1P49642 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRIM1P49642 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRIM1P49642 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRIM1P49642 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRIM1P49642 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PRIM1P49642 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PRIM1P49642 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PRIM1P49642 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PRIM1P49642 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRIM1P49642 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRIM1P49642 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRIM1P49642 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PRIM1P49642 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRIM1P49642 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRIM1P49642 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRIM1P49642 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRIM1P49642 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PRIM1P49642 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PRIM1P49642 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PRIM1P49642 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PRIM1P49642 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PRIM1P49642 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PRIM1P49642 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PRIM1P49642 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PRIM1P49642 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PRIM1P49642 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PRIM1P49642 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PRIM1P49642 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PRIM1P49642 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PRIM1P49642 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
PRIM1P49642 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
PRIM1P49642 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
PRIM1P49642 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
PRIM1P49642 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
PRIM1P49642 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PRIM1P49642 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC32■■■□□ 2.71
PRIM1P49642 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PRIM1P49642 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PRIM1P49642 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PRIM1P49642 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PRIM1P49642 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
PRIM1P49642 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PRIM1P49642 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PRIM1P49642 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
PRIM1P49642 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
PRIM1P49642 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PRIM1P49642 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PRIM1P49642 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PRIM1P49642 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PRIM1P49642 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PRIM1P49642 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
PRIM1P49642 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PRIM1P49642 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PRIM1P49642 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PRIM1P49642 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PRIM1P49642 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PRIM1P49642 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
PRIM1P49642 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PRIM1P49642 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PRIM1P49642 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PRIM1P49642 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PRIM1P49642 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
PRIM1P49642 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PRIM1P49642 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PRIM1P49642 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PRIM1P49642 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PRIM1P49642 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PRIM1P49642 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PRIM1P49642 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PRIM1P49642 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PRIM1P49642 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PRIM1P49642 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PRIM1P49642 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PRIM1P49642 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PRIM1P49642 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PRIM1P49642 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PRIM1P49642 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PRIM1P49642 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PRIM1P49642 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PRIM1P49642 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PRIM1P49642 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PRIM1P49642 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PRIM1P49642 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PRIM1P49642 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PRIM1P49642 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms