Protein–RNA interactions for Protein: P49407

ARRB1, Beta-arrestin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRB1P49407 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARRB1P49407 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ARRB1P49407 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ARRB1P49407 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ARRB1P49407 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARRB1P49407 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARRB1P49407 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARRB1P49407 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARRB1P49407 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARRB1P49407 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARRB1P49407 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARRB1P49407 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARRB1P49407 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARRB1P49407 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARRB1P49407 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARRB1P49407 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARRB1P49407 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ARRB1P49407 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARRB1P49407 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARRB1P49407 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARRB1P49407 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARRB1P49407 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARRB1P49407 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ARRB1P49407 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARRB1P49407 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARRB1P49407 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ARRB1P49407 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARRB1P49407 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ARRB1P49407 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARRB1P49407 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARRB1P49407 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARRB1P49407 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARRB1P49407 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARRB1P49407 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARRB1P49407 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARRB1P49407 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARRB1P49407 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARRB1P49407 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARRB1P49407 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARRB1P49407 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARRB1P49407 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARRB1P49407 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ARRB1P49407 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARRB1P49407 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARRB1P49407 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARRB1P49407 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARRB1P49407 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARRB1P49407 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ARRB1P49407 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARRB1P49407 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARRB1P49407 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARRB1P49407 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ARRB1P49407 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARRB1P49407 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARRB1P49407 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARRB1P49407 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARRB1P49407 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARRB1P49407 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARRB1P49407 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARRB1P49407 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARRB1P49407 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARRB1P49407 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARRB1P49407 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARRB1P49407 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARRB1P49407 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARRB1P49407 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARRB1P49407 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARRB1P49407 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARRB1P49407 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARRB1P49407 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ARRB1P49407 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARRB1P49407 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARRB1P49407 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARRB1P49407 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARRB1P49407 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARRB1P49407 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARRB1P49407 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARRB1P49407 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARRB1P49407 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARRB1P49407 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARRB1P49407 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ARRB1P49407 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARRB1P49407 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARRB1P49407 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARRB1P49407 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARRB1P49407 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARRB1P49407 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARRB1P49407 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ARRB1P49407 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARRB1P49407 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARRB1P49407 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARRB1P49407 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARRB1P49407 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARRB1P49407 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARRB1P49407 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARRB1P49407 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARRB1P49407 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARRB1P49407 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARRB1P49407 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARRB1P49407 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms