Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNNI2P48788 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNNI2P48788 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNNI2P48788 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNNI2P48788 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNNI2P48788 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNNI2P48788 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNNI2P48788 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNNI2P48788 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNNI2P48788 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNNI2P48788 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TNNI2P48788 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TNNI2P48788 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNNI2P48788 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNNI2P48788 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNNI2P48788 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNNI2P48788 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNNI2P48788 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNNI2P48788 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNNI2P48788 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNNI2P48788 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNNI2P48788 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TNNI2P48788 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TNNI2P48788 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNNI2P48788 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNNI2P48788 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNNI2P48788 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNNI2P48788 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNNI2P48788 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNNI2P48788 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNNI2P48788 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TNNI2P48788 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNNI2P48788 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNNI2P48788 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNNI2P48788 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNNI2P48788 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNNI2P48788 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNNI2P48788 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNNI2P48788 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNNI2P48788 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNNI2P48788 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TNNI2P48788 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TNNI2P48788 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNNI2P48788 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNNI2P48788 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TNNI2P48788 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TNNI2P48788 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNNI2P48788 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNNI2P48788 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNNI2P48788 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNNI2P48788 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNNI2P48788 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TNNI2P48788 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNNI2P48788 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNNI2P48788 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNNI2P48788 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TNNI2P48788 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TNNI2P48788 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TNNI2P48788 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNNI2P48788 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNNI2P48788 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNNI2P48788 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNNI2P48788 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNNI2P48788 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TNNI2P48788 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNNI2P48788 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNNI2P48788 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNNI2P48788 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNNI2P48788 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNNI2P48788 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TNNI2P48788 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNNI2P48788 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNNI2P48788 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNNI2P48788 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNNI2P48788 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNNI2P48788 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNNI2P48788 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNNI2P48788 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNNI2P48788 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNNI2P48788 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNNI2P48788 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNNI2P48788 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNNI2P48788 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNNI2P48788 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNNI2P48788 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNNI2P48788 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNNI2P48788 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNNI2P48788 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNNI2P48788 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TNNI2P48788 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNNI2P48788 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNNI2P48788 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNNI2P48788 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNNI2P48788 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNNI2P48788 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNNI2P48788 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNNI2P48788 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNNI2P48788 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNNI2P48788 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNNI2P48788 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms