Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PITPNBP48739 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PITPNBP48739 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PITPNBP48739 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PITPNBP48739 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PITPNBP48739 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PITPNBP48739 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PITPNBP48739 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PITPNBP48739 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PITPNBP48739 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PITPNBP48739 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PITPNBP48739 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PITPNBP48739 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PITPNBP48739 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PITPNBP48739 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PITPNBP48739 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PITPNBP48739 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PITPNBP48739 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PITPNBP48739 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PITPNBP48739 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PITPNBP48739 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PITPNBP48739 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PITPNBP48739 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PITPNBP48739 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PITPNBP48739 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PITPNBP48739 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PITPNBP48739 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PITPNBP48739 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PITPNBP48739 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PITPNBP48739 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PITPNBP48739 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PITPNBP48739 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PITPNBP48739 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PITPNBP48739 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PITPNBP48739 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PITPNBP48739 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PITPNBP48739 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PITPNBP48739 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PITPNBP48739 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PITPNBP48739 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PITPNBP48739 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PITPNBP48739 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PITPNBP48739 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PITPNBP48739 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PITPNBP48739 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PITPNBP48739 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PITPNBP48739 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PITPNBP48739 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PITPNBP48739 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PITPNBP48739 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PITPNBP48739 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PITPNBP48739 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms