Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCT5P48643 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCT5P48643 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCT5P48643 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCT5P48643 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCT5P48643 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCT5P48643 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCT5P48643 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCT5P48643 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCT5P48643 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCT5P48643 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCT5P48643 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCT5P48643 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCT5P48643 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCT5P48643 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCT5P48643 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCT5P48643 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCT5P48643 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCT5P48643 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCT5P48643 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCT5P48643 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCT5P48643 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCT5P48643 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCT5P48643 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCT5P48643 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCT5P48643 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCT5P48643 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCT5P48643 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCT5P48643 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCT5P48643 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCT5P48643 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCT5P48643 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCT5P48643 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCT5P48643 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCT5P48643 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCT5P48643 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCT5P48643 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCT5P48643 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCT5P48643 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCT5P48643 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCT5P48643 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCT5P48643 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCT5P48643 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCT5P48643 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCT5P48643 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCT5P48643 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCT5P48643 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCT5P48643 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCT5P48643 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCT5P48643 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCT5P48643 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT5P48643 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT5P48643 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT5P48643 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT5P48643 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT5P48643 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT5P48643 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT5P48643 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT5P48643 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCT5P48643 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCT5P48643 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCT5P48643 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCT5P48643 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCT5P48643 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCT5P48643 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCT5P48643 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCT5P48643 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCT5P48643 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT5P48643 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT5P48643 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT5P48643 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT5P48643 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT5P48643 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT5P48643 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCT5P48643 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCT5P48643 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCT5P48643 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCT5P48643 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCT5P48643 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCT5P48643 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCT5P48643 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCT5P48643 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCT5P48643 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCT5P48643 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCT5P48643 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCT5P48643 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCT5P48643 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCT5P48643 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCT5P48643 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCT5P48643 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCT5P48643 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCT5P48643 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCT5P48643 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCT5P48643 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCT5P48643 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCT5P48643 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCT5P48643 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCT5P48643 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCT5P48643 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCT5P48643 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms