Protein–RNA interactions for Protein: P48547

KCNC1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC1P48547 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNC1P48547 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNC1P48547 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNC1P48547 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNC1P48547 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNC1P48547 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNC1P48547 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNC1P48547 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNC1P48547 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
KCNC1P48547 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNC1P48547 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNC1P48547 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNC1P48547 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNC1P48547 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNC1P48547 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNC1P48547 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNC1P48547 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNC1P48547 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNC1P48547 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNC1P48547 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNC1P48547 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNC1P48547 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNC1P48547 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNC1P48547 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNC1P48547 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNC1P48547 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNC1P48547 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNC1P48547 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNC1P48547 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNC1P48547 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNC1P48547 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNC1P48547 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNC1P48547 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNC1P48547 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNC1P48547 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNC1P48547 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNC1P48547 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KCNC1P48547 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KCNC1P48547 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNC1P48547 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNC1P48547 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNC1P48547 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNC1P48547 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNC1P48547 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNC1P48547 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNC1P48547 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNC1P48547 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNC1P48547 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNC1P48547 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNC1P48547 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNC1P48547 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNC1P48547 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNC1P48547 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNC1P48547 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNC1P48547 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNC1P48547 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNC1P48547 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNC1P48547 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNC1P48547 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNC1P48547 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNC1P48547 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNC1P48547 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNC1P48547 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNC1P48547 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNC1P48547 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNC1P48547 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNC1P48547 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNC1P48547 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNC1P48547 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNC1P48547 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KCNC1P48547 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KCNC1P48547 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNC1P48547 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNC1P48547 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNC1P48547 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNC1P48547 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNC1P48547 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNC1P48547 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNC1P48547 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNC1P48547 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNC1P48547 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNC1P48547 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNC1P48547 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNC1P48547 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNC1P48547 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNC1P48547 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNC1P48547 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNC1P48547 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNC1P48547 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNC1P48547 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNC1P48547 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNC1P48547 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNC1P48547 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNC1P48547 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNC1P48547 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNC1P48547 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNC1P48547 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNC1P48547 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNC1P48547 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNC1P48547 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms