Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GCLCP48506 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GCLCP48506 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GCLCP48506 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GCLCP48506 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GCLCP48506 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GCLCP48506 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GCLCP48506 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GCLCP48506 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GCLCP48506 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GCLCP48506 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GCLCP48506 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GCLCP48506 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GCLCP48506 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GCLCP48506 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GCLCP48506 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GCLCP48506 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GCLCP48506 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GCLCP48506 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GCLCP48506 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GCLCP48506 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GCLCP48506 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GCLCP48506 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GCLCP48506 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GCLCP48506 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GCLCP48506 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GCLCP48506 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GCLCP48506 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GCLCP48506 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GCLCP48506 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GCLCP48506 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GCLCP48506 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GCLCP48506 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GCLCP48506 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GCLCP48506 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GCLCP48506 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GCLCP48506 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GCLCP48506 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GCLCP48506 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GCLCP48506 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GCLCP48506 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GCLCP48506 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GCLCP48506 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GCLCP48506 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GCLCP48506 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GCLCP48506 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GCLCP48506 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GCLCP48506 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GCLCP48506 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GCLCP48506 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GCLCP48506 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GCLCP48506 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GCLCP48506 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GCLCP48506 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GCLCP48506 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GCLCP48506 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GCLCP48506 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GCLCP48506 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GCLCP48506 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GCLCP48506 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GCLCP48506 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GCLCP48506 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GCLCP48506 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GCLCP48506 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GCLCP48506 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GCLCP48506 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GCLCP48506 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GCLCP48506 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GCLCP48506 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GCLCP48506 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GCLCP48506 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GCLCP48506 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GCLCP48506 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GCLCP48506 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GCLCP48506 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GCLCP48506 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GCLCP48506 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GCLCP48506 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GCLCP48506 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
GCLCP48506 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GCLCP48506 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GCLCP48506 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GCLCP48506 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GCLCP48506 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GCLCP48506 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GCLCP48506 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GCLCP48506 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GCLCP48506 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GCLCP48506 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GCLCP48506 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GCLCP48506 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GCLCP48506 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GCLCP48506 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GCLCP48506 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GCLCP48506 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GCLCP48506 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GCLCP48506 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GCLCP48506 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
GCLCP48506 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GCLCP48506 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 878.5 ms