Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RXRGP48443 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RXRGP48443 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RXRGP48443 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RXRGP48443 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RXRGP48443 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RXRGP48443 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RXRGP48443 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RXRGP48443 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RXRGP48443 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RXRGP48443 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RXRGP48443 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RXRGP48443 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RXRGP48443 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RXRGP48443 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RXRGP48443 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RXRGP48443 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RXRGP48443 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RXRGP48443 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RXRGP48443 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RXRGP48443 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RXRGP48443 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RXRGP48443 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RXRGP48443 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RXRGP48443 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RXRGP48443 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RXRGP48443 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RXRGP48443 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RXRGP48443 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RXRGP48443 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RXRGP48443 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RXRGP48443 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RXRGP48443 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RXRGP48443 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RXRGP48443 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RXRGP48443 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RXRGP48443 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RXRGP48443 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RXRGP48443 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RXRGP48443 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RXRGP48443 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RXRGP48443 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RXRGP48443 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RXRGP48443 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RXRGP48443 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RXRGP48443 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RXRGP48443 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RXRGP48443 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RXRGP48443 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RXRGP48443 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RXRGP48443 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RXRGP48443 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RXRGP48443 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RXRGP48443 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RXRGP48443 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RXRGP48443 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RXRGP48443 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RXRGP48443 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RXRGP48443 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RXRGP48443 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RXRGP48443 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RXRGP48443 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RXRGP48443 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RXRGP48443 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RXRGP48443 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RXRGP48443 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RXRGP48443 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RXRGP48443 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RXRGP48443 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RXRGP48443 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RXRGP48443 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RXRGP48443 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RXRGP48443 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RXRGP48443 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RXRGP48443 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RXRGP48443 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RXRGP48443 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RXRGP48443 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RXRGP48443 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RXRGP48443 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RXRGP48443 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RXRGP48443 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RXRGP48443 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RXRGP48443 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RXRGP48443 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RXRGP48443 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RXRGP48443 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RXRGP48443 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RXRGP48443 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RXRGP48443 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RXRGP48443 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RXRGP48443 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRGP48443 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRGP48443 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RXRGP48443 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRGP48443 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRGP48443 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRGP48443 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRGP48443 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RXRGP48443 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms