Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC6A9P48067 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC6A9P48067 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC6A9P48067 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC6A9P48067 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC6A9P48067 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC6A9P48067 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC6A9P48067 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC6A9P48067 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC6A9P48067 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC6A9P48067 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC6A9P48067 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC6A9P48067 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC6A9P48067 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC6A9P48067 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC6A9P48067 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC6A9P48067 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC6A9P48067 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC6A9P48067 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC6A9P48067 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC6A9P48067 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC6A9P48067 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC6A9P48067 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC6A9P48067 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC6A9P48067 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC6A9P48067 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC6A9P48067 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC6A9P48067 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC6A9P48067 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC6A9P48067 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A9P48067 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A9P48067 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A9P48067 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A9P48067 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A9P48067 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A9P48067 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A9P48067 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A9P48067 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A9P48067 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A9P48067 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A9P48067 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A9P48067 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC6A9P48067 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC6A9P48067 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC6A9P48067 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC6A9P48067 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC6A9P48067 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC6A9P48067 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC6A9P48067 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC6A9P48067 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC6A9P48067 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC6A9P48067 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC6A9P48067 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC6A9P48067 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC6A9P48067 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC6A9P48067 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC6A9P48067 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC6A9P48067 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC6A9P48067 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC6A9P48067 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC6A9P48067 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC6A9P48067 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC6A9P48067 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC6A9P48067 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC6A9P48067 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC6A9P48067 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC6A9P48067 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC6A9P48067 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC6A9P48067 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms