Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNA4P43681 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNA4P43681 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNA4P43681 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNA4P43681 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNA4P43681 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNA4P43681 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNA4P43681 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNA4P43681 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHRNA4P43681 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHRNA4P43681 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHRNA4P43681 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHRNA4P43681 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHRNA4P43681 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNA4P43681 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNA4P43681 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNA4P43681 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNA4P43681 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNA4P43681 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNA4P43681 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNA4P43681 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNA4P43681 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNA4P43681 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNA4P43681 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNA4P43681 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNA4P43681 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNA4P43681 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNA4P43681 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNA4P43681 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNA4P43681 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNA4P43681 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA4P43681 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA4P43681 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA4P43681 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA4P43681 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA4P43681 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA4P43681 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNA4P43681 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNA4P43681 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNA4P43681 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNA4P43681 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNA4P43681 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNA4P43681 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNA4P43681 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNA4P43681 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNA4P43681 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNA4P43681 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNA4P43681 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNA4P43681 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNA4P43681 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNA4P43681 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNA4P43681 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNA4P43681 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNA4P43681 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNA4P43681 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNA4P43681 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNA4P43681 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNA4P43681 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNA4P43681 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNA4P43681 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA4P43681 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA4P43681 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA4P43681 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA4P43681 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA4P43681 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA4P43681 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA4P43681 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA4P43681 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA4P43681 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA4P43681 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA4P43681 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA4P43681 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA4P43681 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA4P43681 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA4P43681 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA4P43681 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA4P43681 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA4P43681 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA4P43681 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA4P43681 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA4P43681 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA4P43681 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA4P43681 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA4P43681 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA4P43681 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA4P43681 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA4P43681 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA4P43681 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA4P43681 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA4P43681 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA4P43681 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA4P43681 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA4P43681 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA4P43681 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA4P43681 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA4P43681 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA4P43681 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA4P43681 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA4P43681 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA4P43681 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms