Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC1A4P43007 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC1A4P43007 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC1A4P43007 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC1A4P43007 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC1A4P43007 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC1A4P43007 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC1A4P43007 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC1A4P43007 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC1A4P43007 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC1A4P43007 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC1A4P43007 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC1A4P43007 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC1A4P43007 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC1A4P43007 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC1A4P43007 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC1A4P43007 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC1A4P43007 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC1A4P43007 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC1A4P43007 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC1A4P43007 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC1A4P43007 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC1A4P43007 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC1A4P43007 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC1A4P43007 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC1A4P43007 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC1A4P43007 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC1A4P43007 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC1A4P43007 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC1A4P43007 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC1A4P43007 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SLC1A4P43007 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC1A4P43007 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC1A4P43007 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC1A4P43007 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC1A4P43007 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC1A4P43007 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC1A4P43007 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC1A4P43007 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC1A4P43007 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC1A4P43007 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC1A4P43007 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC1A4P43007 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC1A4P43007 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC1A4P43007 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC1A4P43007 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC1A4P43007 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC1A4P43007 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC1A4P43007 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC1A4P43007 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC1A4P43007 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC1A4P43007 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC1A4P43007 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC1A4P43007 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC1A4P43007 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC1A4P43007 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC1A4P43007 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC1A4P43007 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC1A4P43007 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC1A4P43007 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC1A4P43007 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC1A4P43007 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC1A4P43007 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC1A4P43007 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC1A4P43007 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC1A4P43007 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC1A4P43007 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC1A4P43007 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC1A4P43007 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC1A4P43007 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC1A4P43007 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC1A4P43007 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC1A4P43007 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC1A4P43007 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC1A4P43007 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC1A4P43007 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC1A4P43007 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC1A4P43007 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC1A4P43007 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC1A4P43007 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC1A4P43007 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC1A4P43007 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC1A4P43007 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC1A4P43007 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC1A4P43007 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC1A4P43007 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC1A4P43007 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC1A4P43007 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC1A4P43007 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC1A4P43007 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC1A4P43007 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC1A4P43007 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC1A4P43007 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC1A4P43007 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC1A4P43007 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC1A4P43007 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC1A4P43007 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC1A4P43007 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC1A4P43007 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC1A4P43007 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms