Protein–RNA interactions for Protein: P43003

SLC1A3, Excitatory amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A3P43003 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A3P43003 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A3P43003 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A3P43003 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A3P43003 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A3P43003 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC1A3P43003 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC1A3P43003 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC1A3P43003 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC1A3P43003 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A3P43003 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A3P43003 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A3P43003 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A3P43003 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A3P43003 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A3P43003 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A3P43003 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A3P43003 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A3P43003 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A3P43003 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A3P43003 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A3P43003 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A3P43003 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A3P43003 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A3P43003 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A3P43003 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A3P43003 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A3P43003 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A3P43003 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A3P43003 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A3P43003 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A3P43003 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A3P43003 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A3P43003 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A3P43003 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A3P43003 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A3P43003 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A3P43003 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A3P43003 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A3P43003 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A3P43003 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A3P43003 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A3P43003 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A3P43003 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A3P43003 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A3P43003 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A3P43003 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A3P43003 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A3P43003 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A3P43003 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A3P43003 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A3P43003 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A3P43003 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A3P43003 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A3P43003 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A3P43003 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A3P43003 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A3P43003 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A3P43003 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A3P43003 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A3P43003 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A3P43003 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A3P43003 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A3P43003 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A3P43003 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A3P43003 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A3P43003 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A3P43003 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A3P43003 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A3P43003 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A3P43003 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A3P43003 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A3P43003 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A3P43003 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A3P43003 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A3P43003 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A3P43003 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A3P43003 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A3P43003 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A3P43003 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A3P43003 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A3P43003 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A3P43003 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A3P43003 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A3P43003 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A3P43003 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A3P43003 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A3P43003 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A3P43003 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A3P43003 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A3P43003 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A3P43003 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A3P43003 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A3P43003 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A3P43003 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A3P43003 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A3P43003 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A3P43003 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A3P43003 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A3P43003 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms