Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PIK3CAP42336 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PIK3CAP42336 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PIK3CAP42336 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PIK3CAP42336 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PIK3CAP42336 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PIK3CAP42336 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PIK3CAP42336 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PIK3CAP42336 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PIK3CAP42336 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PIK3CAP42336 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PIK3CAP42336 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PIK3CAP42336 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PIK3CAP42336 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PIK3CAP42336 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PIK3CAP42336 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PIK3CAP42336 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PIK3CAP42336 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PIK3CAP42336 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PIK3CAP42336 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PIK3CAP42336 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PIK3CAP42336 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PIK3CAP42336 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PIK3CAP42336 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PIK3CAP42336 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PIK3CAP42336 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PIK3CAP42336 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PIK3CAP42336 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PIK3CAP42336 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PIK3CAP42336 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PIK3CAP42336 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PIK3CAP42336 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PIK3CAP42336 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PIK3CAP42336 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PIK3CAP42336 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PIK3CAP42336 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PIK3CAP42336 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIK3CAP42336 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIK3CAP42336 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIK3CAP42336 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIK3CAP42336 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PIK3CAP42336 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIK3CAP42336 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIK3CAP42336 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIK3CAP42336 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PIK3CAP42336 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PIK3CAP42336 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PIK3CAP42336 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PIK3CAP42336 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PIK3CAP42336 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PIK3CAP42336 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PIK3CAP42336 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIK3CAP42336 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIK3CAP42336 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIK3CAP42336 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIK3CAP42336 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIK3CAP42336 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PIK3CAP42336 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIK3CAP42336 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIK3CAP42336 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PIK3CAP42336 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PIK3CAP42336 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIK3CAP42336 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIK3CAP42336 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PIK3CAP42336 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIK3CAP42336 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIK3CAP42336 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIK3CAP42336 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIK3CAP42336 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIK3CAP42336 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIK3CAP42336 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIK3CAP42336 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIK3CAP42336 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIK3CAP42336 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIK3CAP42336 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIK3CAP42336 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PIK3CAP42336 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PIK3CAP42336 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PIK3CAP42336 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PIK3CAP42336 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PIK3CAP42336 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PIK3CAP42336 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PIK3CAP42336 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PIK3CAP42336 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PIK3CAP42336 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PIK3CAP42336 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PIK3CAP42336 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PIK3CAP42336 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PIK3CAP42336 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PIK3CAP42336 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PIK3CAP42336 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PIK3CAP42336 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PIK3CAP42336 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PIK3CAP42336 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PIK3CAP42336 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PIK3CAP42336 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PIK3CAP42336 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PIK3CAP42336 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PIK3CAP42336 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PIK3CAP42336 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms