Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM23P36406 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM23P36406 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM23P36406 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM23P36406 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM23P36406 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM23P36406 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM23P36406 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM23P36406 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM23P36406 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM23P36406 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM23P36406 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM23P36406 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM23P36406 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM23P36406 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM23P36406 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM23P36406 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM23P36406 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM23P36406 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM23P36406 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM23P36406 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM23P36406 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM23P36406 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM23P36406 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM23P36406 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM23P36406 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM23P36406 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM23P36406 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM23P36406 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM23P36406 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM23P36406 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM23P36406 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM23P36406 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM23P36406 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM23P36406 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM23P36406 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM23P36406 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM23P36406 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM23P36406 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM23P36406 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM23P36406 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM23P36406 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM23P36406 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM23P36406 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM23P36406 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM23P36406 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM23P36406 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM23P36406 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM23P36406 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM23P36406 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM23P36406 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM23P36406 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM23P36406 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM23P36406 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM23P36406 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM23P36406 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM23P36406 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM23P36406 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM23P36406 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM23P36406 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM23P36406 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM23P36406 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM23P36406 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM23P36406 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM23P36406 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM23P36406 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM23P36406 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM23P36406 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM23P36406 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM23P36406 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM23P36406 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM23P36406 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM23P36406 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM23P36406 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM23P36406 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM23P36406 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM23P36406 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM23P36406 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM23P36406 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM23P36406 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM23P36406 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM23P36406 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM23P36406 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM23P36406 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM23P36406 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM23P36406 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM23P36406 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM23P36406 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM23P36406 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM23P36406 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM23P36406 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRIM23P36406 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM23P36406 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM23P36406 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM23P36406 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM23P36406 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM23P36406 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM23P36406 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM23P36406 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM23P36406 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms