Protein–RNA interactions for Protein: P35408

PTGER4, Prostaglandin E2 receptor EP4 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER4P35408 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTGER4P35408 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTGER4P35408 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTGER4P35408 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTGER4P35408 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTGER4P35408 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGER4P35408 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGER4P35408 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGER4P35408 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGER4P35408 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGER4P35408 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGER4P35408 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGER4P35408 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGER4P35408 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGER4P35408 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGER4P35408 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGER4P35408 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGER4P35408 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGER4P35408 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGER4P35408 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGER4P35408 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGER4P35408 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGER4P35408 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGER4P35408 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGER4P35408 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGER4P35408 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGER4P35408 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGER4P35408 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGER4P35408 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGER4P35408 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGER4P35408 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGER4P35408 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGER4P35408 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGER4P35408 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGER4P35408 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGER4P35408 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGER4P35408 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGER4P35408 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGER4P35408 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGER4P35408 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGER4P35408 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGER4P35408 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGER4P35408 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGER4P35408 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGER4P35408 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTGER4P35408 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTGER4P35408 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTGER4P35408 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGER4P35408 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGER4P35408 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGER4P35408 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGER4P35408 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGER4P35408 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGER4P35408 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGER4P35408 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGER4P35408 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGER4P35408 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGER4P35408 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGER4P35408 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGER4P35408 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGER4P35408 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGER4P35408 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGER4P35408 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGER4P35408 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGER4P35408 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGER4P35408 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGER4P35408 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGER4P35408 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTGER4P35408 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTGER4P35408 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGER4P35408 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGER4P35408 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGER4P35408 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGER4P35408 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGER4P35408 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGER4P35408 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGER4P35408 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGER4P35408 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGER4P35408 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGER4P35408 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGER4P35408 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGER4P35408 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGER4P35408 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGER4P35408 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGER4P35408 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGER4P35408 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGER4P35408 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGER4P35408 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGER4P35408 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGER4P35408 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGER4P35408 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGER4P35408 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGER4P35408 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGER4P35408 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGER4P35408 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGER4P35408 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGER4P35408 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGER4P35408 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGER4P35408 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGER4P35408 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms