Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCKBRP32239 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCKBRP32239 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCKBRP32239 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCKBRP32239 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCKBRP32239 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCKBRP32239 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCKBRP32239 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCKBRP32239 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCKBRP32239 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCKBRP32239 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCKBRP32239 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCKBRP32239 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCKBRP32239 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCKBRP32239 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCKBRP32239 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCKBRP32239 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCKBRP32239 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCKBRP32239 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCKBRP32239 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCKBRP32239 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCKBRP32239 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCKBRP32239 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCKBRP32239 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCKBRP32239 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCKBRP32239 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCKBRP32239 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCKBRP32239 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCKBRP32239 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCKBRP32239 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCKBRP32239 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCKBRP32239 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCKBRP32239 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCKBRP32239 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCKBRP32239 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCKBRP32239 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCKBRP32239 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCKBRP32239 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCKBRP32239 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCKBRP32239 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCKBRP32239 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCKBRP32239 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCKBRP32239 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCKBRP32239 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCKBRP32239 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCKBRP32239 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCKBRP32239 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCKBRP32239 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCKBRP32239 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCKBRP32239 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCKBRP32239 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCKBRP32239 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCKBRP32239 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCKBRP32239 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCKBRP32239 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCKBRP32239 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCKBRP32239 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCKBRP32239 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCKBRP32239 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCKBRP32239 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCKBRP32239 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCKBRP32239 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCKBRP32239 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCKBRP32239 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCKBRP32239 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCKBRP32239 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCKBRP32239 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCKBRP32239 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCKBRP32239 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCKBRP32239 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCKBRP32239 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCKBRP32239 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCKBRP32239 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCKBRP32239 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCKBRP32239 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCKBRP32239 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCKBRP32239 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCKBRP32239 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCKBRP32239 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCKBRP32239 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCKBRP32239 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCKBRP32239 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCKBRP32239 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCKBRP32239 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCKBRP32239 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCKBRP32239 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCKBRP32239 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCKBRP32239 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCKBRP32239 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCKBRP32239 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCKBRP32239 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCKBRP32239 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCKBRP32239 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCKBRP32239 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCKBRP32239 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCKBRP32239 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCKBRP32239 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCKBRP32239 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCKBRP32239 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCKBRP32239 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms