Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
CLIP1P30622 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
CLIP1P30622 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
CLIP1P30622 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
CLIP1P30622 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
CLIP1P30622 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
CLIP1P30622 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
CLIP1P30622 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
CLIP1P30622 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
CLIP1P30622 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
CLIP1P30622 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
CLIP1P30622 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
CLIP1P30622 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
CLIP1P30622 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
CLIP1P30622 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
CLIP1P30622 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
CLIP1P30622 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.09■■■■□ 3.85
CLIP1P30622 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
CLIP1P30622 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
CLIP1P30622 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
CLIP1P30622 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
CLIP1P30622 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
CLIP1P30622 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.08■■■■□ 3.85
CLIP1P30622 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC39.08■■■■□ 3.85
CLIP1P30622 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
CLIP1P30622 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
CLIP1P30622 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
CLIP1P30622 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
CLIP1P30622 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC39.07■■■■□ 3.84
CLIP1P30622 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
CLIP1P30622 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
CLIP1P30622 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
CLIP1P30622 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
CLIP1P30622 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
CLIP1P30622 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.06■■■■□ 3.84
CLIP1P30622 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
CLIP1P30622 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
CLIP1P30622 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
CLIP1P30622 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
CLIP1P30622 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
CLIP1P30622 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
CLIP1P30622 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
CLIP1P30622 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
CLIP1P30622 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
CLIP1P30622 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
CLIP1P30622 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC39.02■■■■□ 3.84
CLIP1P30622 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
CLIP1P30622 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC39.02■■■■□ 3.84
CLIP1P30622 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
CLIP1P30622 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
CLIP1P30622 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
CLIP1P30622 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
CLIP1P30622 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
CLIP1P30622 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC39■■■■□ 3.83
CLIP1P30622 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
CLIP1P30622 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
CLIP1P30622 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
CLIP1P30622 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
CLIP1P30622 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
CLIP1P30622 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
CLIP1P30622 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
CLIP1P30622 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
CLIP1P30622 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
CLIP1P30622 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC38.98■■■■□ 3.83
CLIP1P30622 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
CLIP1P30622 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
CLIP1P30622 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
CLIP1P30622 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC38.97■■■■□ 3.83
CLIP1P30622 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
CLIP1P30622 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
CLIP1P30622 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
CLIP1P30622 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
CLIP1P30622 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
CLIP1P30622 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
CLIP1P30622 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
CLIP1P30622 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC38.95■■■■□ 3.83
CLIP1P30622 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CLIP1P30622 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
CLIP1P30622 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
CLIP1P30622 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CLIP1P30622 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CLIP1P30622 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CLIP1P30622 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CLIP1P30622 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
CLIP1P30622 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
CLIP1P30622 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
CLIP1P30622 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
CLIP1P30622 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
CLIP1P30622 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
CLIP1P30622 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
CLIP1P30622 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
CLIP1P30622 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
CLIP1P30622 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
CLIP1P30622 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
CLIP1P30622 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
CLIP1P30622 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CLIP1P30622 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CLIP1P30622 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CLIP1P30622 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CLIP1P30622 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms