Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CMPK1P30085 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CMPK1P30085 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CMPK1P30085 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CMPK1P30085 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CMPK1P30085 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CMPK1P30085 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CMPK1P30085 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CMPK1P30085 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CMPK1P30085 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CMPK1P30085 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CMPK1P30085 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CMPK1P30085 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CMPK1P30085 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CMPK1P30085 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CMPK1P30085 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CMPK1P30085 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CMPK1P30085 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CMPK1P30085 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CMPK1P30085 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CMPK1P30085 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CMPK1P30085 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CMPK1P30085 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CMPK1P30085 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CMPK1P30085 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CMPK1P30085 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMPK1P30085 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMPK1P30085 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMPK1P30085 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMPK1P30085 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CMPK1P30085 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMPK1P30085 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMPK1P30085 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMPK1P30085 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMPK1P30085 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMPK1P30085 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CMPK1P30085 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMPK1P30085 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMPK1P30085 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMPK1P30085 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMPK1P30085 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMPK1P30085 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMPK1P30085 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMPK1P30085 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMPK1P30085 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CMPK1P30085 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CMPK1P30085 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CMPK1P30085 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CMPK1P30085 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CMPK1P30085 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CMPK1P30085 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CMPK1P30085 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CMPK1P30085 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms