Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCSK1P29120 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCSK1P29120 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCSK1P29120 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCSK1P29120 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PCSK1P29120 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCSK1P29120 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCSK1P29120 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCSK1P29120 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCSK1P29120 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCSK1P29120 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCSK1P29120 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCSK1P29120 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCSK1P29120 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCSK1P29120 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCSK1P29120 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCSK1P29120 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCSK1P29120 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCSK1P29120 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCSK1P29120 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCSK1P29120 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCSK1P29120 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PCSK1P29120 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCSK1P29120 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCSK1P29120 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCSK1P29120 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCSK1P29120 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCSK1P29120 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCSK1P29120 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCSK1P29120 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCSK1P29120 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCSK1P29120 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCSK1P29120 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCSK1P29120 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCSK1P29120 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCSK1P29120 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCSK1P29120 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCSK1P29120 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCSK1P29120 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCSK1P29120 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCSK1P29120 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCSK1P29120 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCSK1P29120 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCSK1P29120 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCSK1P29120 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCSK1P29120 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCSK1P29120 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCSK1P29120 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCSK1P29120 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCSK1P29120 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCSK1P29120 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCSK1P29120 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PCSK1P29120 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCSK1P29120 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PCSK1P29120 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PCSK1P29120 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCSK1P29120 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCSK1P29120 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCSK1P29120 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCSK1P29120 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCSK1P29120 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PCSK1P29120 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCSK1P29120 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCSK1P29120 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCSK1P29120 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCSK1P29120 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCSK1P29120 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCSK1P29120 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCSK1P29120 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCSK1P29120 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCSK1P29120 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCSK1P29120 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PCSK1P29120 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PCSK1P29120 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PCSK1P29120 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCSK1P29120 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCSK1P29120 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCSK1P29120 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCSK1P29120 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCSK1P29120 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCSK1P29120 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCSK1P29120 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCSK1P29120 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCSK1P29120 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCSK1P29120 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCSK1P29120 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCSK1P29120 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCSK1P29120 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCSK1P29120 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCSK1P29120 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCSK1P29120 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCSK1P29120 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCSK1P29120 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCSK1P29120 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCSK1P29120 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCSK1P29120 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCSK1P29120 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCSK1P29120 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCSK1P29120 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCSK1P29120 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms