Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF8P28908 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF8P28908 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF8P28908 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF8P28908 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF8P28908 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF8P28908 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF8P28908 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF8P28908 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF8P28908 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF8P28908 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF8P28908 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF8P28908 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFRSF8P28908 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFRSF8P28908 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFRSF8P28908 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFRSF8P28908 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFRSF8P28908 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFRSF8P28908 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFRSF8P28908 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFRSF8P28908 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFRSF8P28908 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFRSF8P28908 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNFRSF8P28908 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNFRSF8P28908 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNFRSF8P28908 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFRSF8P28908 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFRSF8P28908 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFRSF8P28908 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFRSF8P28908 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFRSF8P28908 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFRSF8P28908 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFRSF8P28908 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFRSF8P28908 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFRSF8P28908 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFRSF8P28908 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFRSF8P28908 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFRSF8P28908 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFRSF8P28908 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFRSF8P28908 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFRSF8P28908 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFRSF8P28908 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFRSF8P28908 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFRSF8P28908 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFRSF8P28908 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFRSF8P28908 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFRSF8P28908 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFRSF8P28908 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFRSF8P28908 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFRSF8P28908 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFRSF8P28908 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFRSF8P28908 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFRSF8P28908 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFRSF8P28908 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFRSF8P28908 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFRSF8P28908 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFRSF8P28908 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFRSF8P28908 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFRSF8P28908 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFRSF8P28908 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF8P28908 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF8P28908 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF8P28908 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF8P28908 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF8P28908 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF8P28908 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF8P28908 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF8P28908 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF8P28908 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF8P28908 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF8P28908 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF8P28908 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF8P28908 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF8P28908 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF8P28908 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF8P28908 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF8P28908 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF8P28908 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF8P28908 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF8P28908 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF8P28908 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF8P28908 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF8P28908 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF8P28908 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF8P28908 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF8P28908 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF8P28908 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF8P28908 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF8P28908 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF8P28908 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF8P28908 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFRSF8P28908 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFRSF8P28908 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFRSF8P28908 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFRSF8P28908 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFRSF8P28908 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFRSF8P28908 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFRSF8P28908 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF8P28908 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms