Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PTPRMP28827 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PTPRMP28827 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PTPRMP28827 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PTPRMP28827 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
PTPRMP28827 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
PTPRMP28827 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PTPRMP28827 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PTPRMP28827 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PTPRMP28827 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PTPRMP28827 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PTPRMP28827 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PTPRMP28827 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PTPRMP28827 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PTPRMP28827 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PTPRMP28827 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PTPRMP28827 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PTPRMP28827 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PTPRMP28827 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PTPRMP28827 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PTPRMP28827 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PTPRMP28827 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
PTPRMP28827 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PTPRMP28827 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PTPRMP28827 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PTPRMP28827 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PTPRMP28827 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
PTPRMP28827 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PTPRMP28827 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
PTPRMP28827 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PTPRMP28827 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PTPRMP28827 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PTPRMP28827 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PTPRMP28827 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PTPRMP28827 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PTPRMP28827 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PTPRMP28827 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PTPRMP28827 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PTPRMP28827 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PTPRMP28827 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PTPRMP28827 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PTPRMP28827 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PTPRMP28827 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PTPRMP28827 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PTPRMP28827 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PTPRMP28827 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PTPRMP28827 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PTPRMP28827 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PTPRMP28827 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PTPRMP28827 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PTPRMP28827 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
PTPRMP28827 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PTPRMP28827 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PTPRMP28827 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PTPRMP28827 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
PTPRMP28827 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PTPRMP28827 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
PTPRMP28827 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
PTPRMP28827 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PTPRMP28827 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PTPRMP28827 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PTPRMP28827 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PTPRMP28827 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PTPRMP28827 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
PTPRMP28827 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PTPRMP28827 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PTPRMP28827 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PTPRMP28827 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PTPRMP28827 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PTPRMP28827 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
PTPRMP28827 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PTPRMP28827 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
PTPRMP28827 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
PTPRMP28827 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PTPRMP28827 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PTPRMP28827 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
PTPRMP28827 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
PTPRMP28827 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
PTPRMP28827 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
PTPRMP28827 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
PTPRMP28827 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
PTPRMP28827 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
PTPRMP28827 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PTPRMP28827 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PTPRMP28827 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PTPRMP28827 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PTPRMP28827 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PTPRMP28827 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PTPRMP28827 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PTPRMP28827 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PTPRMP28827 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PTPRMP28827 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PTPRMP28827 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PTPRMP28827 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PTPRMP28827 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PTPRMP28827 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PTPRMP28827 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PTPRMP28827 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC36.44■■■■□ 3.42
PTPRMP28827 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
PTPRMP28827 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms