Protein–RNA interactions for Protein: P27694

RPA1, Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA1P27694 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPA1P27694 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPA1P27694 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPA1P27694 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPA1P27694 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPA1P27694 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPA1P27694 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPA1P27694 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPA1P27694 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPA1P27694 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RPA1P27694 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPA1P27694 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPA1P27694 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPA1P27694 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
RPA1P27694 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPA1P27694 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPA1P27694 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPA1P27694 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPA1P27694 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPA1P27694 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPA1P27694 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPA1P27694 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPA1P27694 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPA1P27694 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPA1P27694 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RPA1P27694 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPA1P27694 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPA1P27694 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPA1P27694 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPA1P27694 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPA1P27694 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPA1P27694 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPA1P27694 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPA1P27694 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPA1P27694 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPA1P27694 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPA1P27694 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPA1P27694 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPA1P27694 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPA1P27694 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPA1P27694 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPA1P27694 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RPA1P27694 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPA1P27694 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPA1P27694 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPA1P27694 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPA1P27694 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPA1P27694 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPA1P27694 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RPA1P27694 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPA1P27694 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPA1P27694 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPA1P27694 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPA1P27694 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPA1P27694 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RPA1P27694 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPA1P27694 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPA1P27694 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPA1P27694 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPA1P27694 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPA1P27694 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPA1P27694 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPA1P27694 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RPA1P27694 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RPA1P27694 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPA1P27694 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPA1P27694 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPA1P27694 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPA1P27694 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPA1P27694 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPA1P27694 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPA1P27694 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPA1P27694 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPA1P27694 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPA1P27694 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RPA1P27694 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPA1P27694 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPA1P27694 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPA1P27694 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPA1P27694 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPA1P27694 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPA1P27694 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPA1P27694 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RPA1P27694 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPA1P27694 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPA1P27694 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPA1P27694 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPA1P27694 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPA1P27694 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPA1P27694 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPA1P27694 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPA1P27694 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPA1P27694 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPA1P27694 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPA1P27694 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPA1P27694 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPA1P27694 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPA1P27694 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RPA1P27694 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RPA1P27694 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms